| structure name | E-DREI |
| reference | Monnat Jr. et al. Mol.Cell 10 895 2002 |
| experiment | X-ray (resolution=2.40, R-factor=?) |
| structural superfamily | Homing endonucleases; |
| sequence family | LAGLIDADG endonuclease; |
| links to other resources | NAKB  PDIdb DNAproDB |
| protein sequence | |
| interface signature | YLYRSERTQVDTRERSSIQKNSYQQTYRRVT |
Estimated binding specificities ?
| readout + contact |  |
A | 0 96 96 61 0 0 0 0 0 24 24 45 87 0 0 0 0 0 0 0 0 C | 96 0 0 8 96 0 0 0 96 24 24 17 0 0 0 17 96 96 0 0 96 G | 0 0 0 17 0 0 96 0 0 24 24 17 8 96 0 0 0 0 96 96 0 T | 0 0 0 10 0 96 0 96 0 24 24 17 1 0 96 79 0 0 0 0 0scan! |
Dendrogram of similar interfaces ?
matrix format--YTLT--YC----RGSGECRG----TG------QG--VG----DCTARTEARGSCSAIAQA--KG--NT--SCYAQA----QA--TGYC--RG--RG----VA----------------TC-- L +----1mow_A +------13 STIT----------RG--RG----YC--TC----YC--RG--SG----VAQT----STITQA--KG--RG--STNTQT----AT--TC----YT--SC----VC--DTRG--ST----KGTG-- L ! ! +-3mxa_A ! +-11 SAYCKA----------------------IG----RG----RT--DT--IADG--IASAYCKT--ITPTRGDCYA------------IG--NA--RT--DT--IC--DG----IA---------- L +----15 +-3fd2_A ! ! --------------------------------------------------------CA--QG--VT--RG--DCYA--RT------FA----RGRGNTDT--MC--EA------------KT-- L ! ! +-5a74_B ! +---------12 --------------------------------------------------------SAIAQA----------SC--RGKG--QA--TAYC------ST----VA--------------KTTT-- L ! +-2vbl_B ! ST------------AT--LCYC--EC--AT----YG--NA--SADC--TCKTKGSACTFTST--YA--ST--KTSTATQA--KT--TGRA--RG--------AT--DT----TA---------- L ! +4lq0_A ! ! CGRG--ST--TTKARG--QTFA--QG--NG------HC--SC------LAQGRGQACCMT----AC--ST--AT--QAYA--IC--TART------KGRT--VA--EC--QT------------ L ! ! +4yit_A ! ! +-4 STMG----------RT----RGVT--SA------FC----MC------STQTRGECCTSTVA--FT--ST--TCSCATKA--IT--TC----STDA--RG--TC----KT--TG---------- L +-----18 ! +-6 +5esp_A ! ! +----------------9 ! ! SA------------ST--EC----QG--TA----------ST------AT--KG--CAFCNT----IT--STKT--QAQA------TAKG--YG--KG----WT--------TA---------- L ! ! ! ! ! +6bd0_A ! ! ! ! +-7 STIGRG--------LT--EC--ST--KG--------TT--NA--------MGRTSCHT--NC--WC--RG--------QG------STLA--KG--RG----WC----RG--TG---------- L ! ! ! ! ! ! +5t2n_A ! ! ! ! ! ! +-1 SA----------------EC----EC--KG----------ST------ATRGRG--CAFTNT----LA--------QACT--SA----LA--KG--------WC--EA----TT---------- L ! ! ! +-8 +-5 +6uw0_B ! ! ! ! ! SALT----------ST--EC----QG--TAHAKA------ST----------KGTCCAFCNT----SC--KG--TTQAKG------SC--------------WC--EA----TG---------- L ! ! ! ! +6uwj_A ! +-17 ! --MGTA--------ST--RGRG--RG----------------------DTRGRCECSAYCRA--AT--NT--TCLCQAQA--QA--TG------RG--RG--CC--------TARG-------- L ! ! +6bce_A -19 ! --------------------------------------------------------STITQA--KG--RG--STNTQTST--AT--TC----YT--SC----VC--DTRG--ST----KGTG-- L ! ! +3mxb_B ! ! +-2 --------------------------------------------------------SGIGQA--KG--NC--SC--RGQG--DG--TAYC--AT--SC----VC--KGRG----------TT-- L ! ! +-3 +6fb0_A ! ! ! ! --------------------------------------------------------STITQA--NG--NT--SC--RGRG--YC--TC----RG--------VC--QT------------TT-- L ! ! +-------------10 +2xe0_A ! ! ! ! --------------------------------------------------------SAYCLC--IT--RGDCYA--QG--------IG--NA--RG--DT--IC----RG-------------- L ! +-16 +2fld_B ! ! --------------------------------------------------------SANCSC--KG--LT--------DAECNA--TG----RC------------------DA--QA----QC L ! +---------------2ex5_A ! --YTLT--YC----RGSGECRGVT--TG------QG--VG------TARTEARGSC----------------------------WC------DCDC--RGHA--VC------------------ L ! +---------2vs7_A +--------------14 YGRGRG----------------QG--EC----------------------------------WADT------------------------------NCKT------------------------ L +---------3c0w_A |
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updated Tue Dec 19 05:55:48 2023