3tu4_ABCDEFGHKL : 3D-footprint complex

structure name	CRYSTAL STRUCTURE OF THE SIR3 BAH DOMAIN IN COMPLEX WITH A NUCLEOSOME CORE PARTICLE.
reference	Armache et al. Science 334 977 2011
source	SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C / XENOPUS LAEVIS
experiment	X-ray (resolution=3.00, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 3tu4_A interface=3,4,5,27,47, kpHRYrpgtvalreirryqkstelliRklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 3tu4_B interface=33, ggakrhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 3tu4_C interface= akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervGagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 3tu4_D interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 3tu4_E interface=2,44, rYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 3tu4_F interface= gGakrhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrGvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 3tu4_G interface= aKaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavLeyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 3tu4_H interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 3tu4_K interface= aKtlkdldgwqviitddqgrviddnnrrrsrkrggenvflkrisdglsfgkgesvifndnvtetysvyliheirlntlnnvveiwvfsylrwfelkpklyyeqfrpdlikedhplefykdkffnevnkselyltaelseiwlkdfiavgqilpesqwndssidkiedrdflvryaceptaekfvpidifqiirrvkemepkqsneylkrvsvsv > 3tu4_L interface= aKtlkdldgwqviitddqgrviddnnrrrsrkrggenvflkrisdglsfgkgesvifndnvtetysvyliheirlntlnnvveiwvfsylrwfelkpklyyeqfrpdlikedhplefykdkffnevnkselyltaelseiwlkdfiavgqilpesqwndssidkiedrdflvryaceptaekfvpidifqiirrvkemepkqsneylkrvsvs
interface signature	HRYRR/R/G/R/YR/GG/KL/R/K/K

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.617 IC/col=0.004 n_of_columns=146

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  16  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  19  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  21  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  48  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  39  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  23  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  16  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  19  39  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  31  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  16  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  19  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24

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