5j0n_EKLMNO : 3D-footprint complex

structure name	LAMBDA EXCISION HJ INTERMEDIATE
source	ENTEROBACTERIA PHAGE LAMBDA / ESCHERICHIA COLI
experiment	NMR
structural superfamily	DNA breaking-rejoining enzymes;DNA-binding domain;
reference complex	5j0n_F
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 5j0n_E interface=24,25,28,29,31,32,67,68,70,71,74,106,164,213,216, nsvtlhswldryekilasrgikqKTliNYmSKikairrglpdapledittkeiaamlngyidegkaASaKLirStlsdafreaiaeghittnhvaatraaksevrRsrltadeylkiyqaaesspcwlrlamelavvtgqrvgdlcemkwsdivdgylyveqsKtgvkiaiptalhidalgismketldkckeilggetiiastrreplssgTvsRyfmrarkasglsfegdpptfhelrslsarlyekqisdkfaqhllghksdtewdkieik > 5j0n_K interface=59,62,63,64,65,72, altkaemseylfdklglskrdakelvelffeeirralengeqvklsgfgnfdlrdknqRpgRNPKtgedipItarrvvtfrpgqklksrvenaspk > 5j0n_L interface=46,59,62,63,64,65, mtkselierlatqqshipaktvedavkemlehmastlaqgerieiRgfgsfslhyrapRtgRNPKtgdkvelegkyvphfkpgkelrdraniyg > 5j0n_M interface=19,22,23,39, myltlqewnarqrrprslEtvRRwvresrifpppvkdgReylfhesavkvdln > 5j0n_N interface=19,22, myltlqewnarqrrprslEtvRrwvresrifpppvkdgreylfhesavkvdlnr > 5j0n_O interface=17,19, myltlqewnarqrrprSlEtvrrwvresrifpppvkdgreylfhesavkvdlnrp
interface signature	KTNYSKASKLSRKTR/RRNPKI/RRRNPK/ERRR/ER/SE

Estimated binding specificities ?

readout + contact

# IC=8.553 IC/col=0.072 n_of_columns=118

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  16  23  24  20  24  17  24  25  24  19  24  24  24  20  24  60  24  24  24  24  24  22  24  22  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  52   0   0  14  45  24  24  24  24  24  96   0  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  16  25  38  21  15   3  13  16  27  31  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  14  21  24  20  24  15  24  22  24  20  24  24  24  22  24  12  24  24  24  24  24  25  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  14   0   0  14  16  24  24  24  24  24   0   0  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  27  19  23  49   3  13  19  22  21  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  17  52  21  24  36  24  49  24  22  24  19  24  24  24  34  24  12  24  24  24  24  24  22  24  34  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  16   0   0  52  19  24  24  24  24  24   0   0  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  16  22  20  31  15   5  14  16  25  23  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  49  14  31  24  20  24  15  24  27  24  38  24  24  24  20  24  12  24  24  24  24  24  27  24  20  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  24  24  24  24  24  14  96  96  16  16  24  24  24  24  24   0  96  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  45  22  19  21  17  85  56  45  22  21  24  24

scan!

home
updated Sat Dec 16 02:54:47 2023