5o9g_ABCDEFGHW : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF NUCLEOSOME-CHD1 COMPLEX
source	XENOPUS LAEVIS / SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 5o9g_A interface=3,28,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5o9g_B interface= krHrkvlrdniqgitkpairrlarrggVkrisgliyeetrgvlkvFlenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5o9g_C interface=27, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5o9g_D interface=3,9, ktRkesyaIyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 5o9g_E interface=2, hRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5o9g_F interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5o9g_G interface=22, aktrssraglqfpvgrvhrllRkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5o9g_H interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5o9g_W interface=58,442,736,844, dfhgidivinhrlktsktvpdlnnckenyeflikwtdeshlhntwetyesigqvrglKrldnyckqfiiedqqvrldpyvtaedieimdmererrldefeefhvperiidsqrasledgtsqlqylvkwrrlnydeatwenatdivklapeqvkhfqnrenskilpqyssnytsqrprfeklsvqppfikggelrdfqltginwmaflwskgdngilademglgktvqtvafiswlifarrqngphiivvplstmpawldtfekwapdlncicymgnqksrdtireyefytnpktmkfnvllttyeyilkdraelgsikwqfmavdeahrlknaesslyeslnsfkvanrmlitgtplqnnikelaalvnflmpgrfnqdeeqeeyihdlhrriqpfilrrlkkdvekslpskterilrvelsdvqteyykniltknysimNelkkasnhpylfdnaeervlqkfmtrenvlrglimssgkmvlldqlltrlkkdghrvlifsqmvrmldilgdylsikginfqrldgtvpsaqrrisidhfnspdsndfvfllstragglginlmtadtvvifdsdwnpqadlqamarahrigqknhvmvyrlvskdtveeevlerarkkmileydmdsigesevralykailkfgnlkeildeliadgtlpvksfekygetydemmeaakdcvheeeknrkeileklekhatayraklksgeikaenqpkdnpltrlslkkreKkavlfnfkgvkslnaesllsrvedlkylknlinsnykddplkfslgnntpkpvqnwssnwtkeedeklligvfkygygswtqirddpflgitdkiflkkvpgaihlgRrvdyllsflrg
interface signature	RLR/HVF/R/RI/R/R/R/R/KNKR

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.528 IC/col=0.009 n_of_columns=161

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  12  22  19  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  22  19  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  21  16  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  18  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  74  12  22  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  20  38  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  23  14  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   8  60  30  38  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  34  20  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  21  52  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  42  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  12  22  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  20  19  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  31  14  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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