5wcu_ABCDEFGHU : 3D-footprint complex

structure name	CRYSTAL STRUCTURE OF 167 BP NUCLEOSOME BOUND TO THE GLOBULAR DOMAIN OF LINKER HISTONE H5
reference	Jiang et al. 'J. 430 3093 2018
source	DROSOPHILA MELANOGASTER / GALLUS GALLUS
experiment	X-ray (resolution=5.53, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 5wcu_A interface=3, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5wcu_B interface=23, rdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5wcu_C interface=28, ksrsnraglqfpvgrihrllrkgnyaeRvgagapvylaavmeylaaevlelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllsgvtiaqggvlpniqavllpk > 5wcu_D interface=3, rkRkesyaiyiykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndiferiaaeasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytss > 5wcu_E interface=3,4,28,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5wcu_F interface=11,25, vlrdniqgitKpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5wcu_G interface=27, srsnraglqfpvgrihrllrkgnyaeRvgagapvylaavmeylaaevlelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllsgvtiaqggvlpniqavllpk > 5wcu_H interface= krkesyaiyiykvlkqvhpdtgisskAmsimnsfvndiferiaaeasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytss > 5wcu_U interface=21,69, sashptysemiaaairaeksRggssrqsiqkyikshykvghnadlqiklsirrllaagvlkqtkgvgaSgsfrlak
interface signature	R/R/R/R/RYLR/KR/R/A/RS

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.930 IC/col=0.012 n_of_columns=164

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  20  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  22  24  25  24  24  21  24  24  24  24  24  18  20  24  24  24  22  24  24  16  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19  24  24  24  24  24  24  24  24  45  15  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  17  20   6  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  27  22  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  27  24  27  24  24  23  24  24  24  24  24  18  36  24  24  24  22  24  24  16  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  19  24  24  24  24  24  24  24  24  16  15  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  15  34  78  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  20  24  24  24  24  24  45  24  24  24  24  24  24  25  24  22  24  24  31  24  24  24  24  24  42  20  24  24  24  25  24  24  45  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  38  24  24  24  24  24  24  24  24  16  51  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  49  20   6  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  34  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  21  24  24  24  24  24  18  20  24  24  24  27  24  24  19  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  20  24  24  24  24  24  24  24  24  19  15  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  15  22   6  24  24  24

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