5wcu_KLMNOPQRV : 3D-footprint complex

structure name	CRYSTAL STRUCTURE OF 167 BP NUCLEOSOME BOUND TO THE GLOBULAR DOMAIN OF LINKER HISTONE H5
reference	Jiang et al. 'J. 430 3093 2018
source	DROSOPHILA MELANOGASTER / GALLUS GALLUS
experiment	X-ray (resolution=5.53, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 5wcu_K interface=3, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 5wcu_L interface=23, rdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5wcu_M interface=28, ksrsnraglqfpvgrihrllrkgnyaeRvgagapvylaavmeylaaevlelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllsgvtiaqggvlpniqavllpk > 5wcu_N interface=3, rkRkesyaiyiykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndiferiaaeasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytss > 5wcu_O interface=3,4,6,28,46, phRYrPgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5wcu_P interface=12,15,25, vlrdniqgitkPaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5wcu_Q interface=2,27, sRsnraglqfpvgrihrllrkgnyaeRvgagapvylaavmeylaaevlelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllsgvtiaqggvlpniqavllpk > 5wcu_R interface=8, krkesyaIyiykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndiferiaaeasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytss > 5wcu_V interface=46, sashptysemiaaairaeksrggssrqsiqkyikshykvghnadlQiklsirrllaagvlkqtkgvgasgsfrlak
interface signature	R/R/R/R/RYPLR/PRR/RR/I/Q

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.468 IC/col=0.009 n_of_columns=162

specificity:

A |  24  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  38  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  20  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  27  24  24  20  17  20  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  23  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  24  24  24  24  24  24  24  24  38   8  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  30  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  19  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  22  24  24  20  49  22  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  21  24  24  24  24  24  24  24  24  19   7  49  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  20  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  19  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  25  24  24  36  15  34  30  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  31  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  31  24  24  24  24  24  24  24  24  20  74  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  38  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  22  24  24  20  15  20  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  21  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  23  24  24  24  24  24  24  24  24  19   7  17  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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