5z3l_ABCDEFGHO : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF SNF2-NUCLEOSOME COMPLEX IN APO STATE
source	XENOPUS LAEVIS / SACCHAROMYCES CEREVISIAE
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 5z3l_A interface=4,27, kphRyrpgtvalreirryqkstelliRklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5z3l_B interface=31, akrhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 5z3l_C interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5z3l_D interface= trkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsiMnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5z3l_E interface=2, rYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5z3l_F interface= rHrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5z3l_G interface= aKaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5z3l_H interface= tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5z3l_O interface=153,308,311,397,444, lldqtkdtrithllrqtnafldyynvahrikedikkqpsilvggtlkdyqikglqwmvslfnnhlngilademglgktiqtislltylyemknirgpylvivplstlsnwssefakwaptlrtisfkgspnerkakqakiragefdvvlttfEyiikerallskvkwvhmiideghrmknaqsklsltlnthyhadyrliltgtplqnnlpelwallnfvlpkifnsvksfdewfntpfdkielseeetllvirrlhkvlrpfllrrlkkdvekelpdkvekvvkckmsalqqimyqqmlkyrrlgfNnqImqlkkicnhpfvfeevedqinptretnddiwrvagkfelldrilpklkatghrvliffqmtqimdimedflryinikylrldghtKsdersellrlfnapdseylcfilstragglglnlqtadtviifdtdWnphqdlqaqdrahrigqknevrilrlittnsveevileraykkldidgkviqagkfdnkstseeqeallrslldaeeerrkkreelkdseineilarndeemavltrmdedrskkeeksrllekkreesesaavyng
interface signature	RR/R/R/M/Y/H/K/R/ENIKW

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.661 IC/col=0.005 n_of_columns=145

specificity:

A |  24  24  24  19  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  14  24  24  24  16  18  20  22  24  24  24  24  24  25  22  21  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  19  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  14  24  24  24  19  18  20  22  24  24  24  24  24  22  30  23  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  38  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  14  24  24  24  45  42  20  25  24  24  24  24  24  27  22  31  24  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  20  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  54  24  24  24  16  18  36  27  24  24  24  24  24  22  22  21  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Tue Nov 29 13:28:39 2022