5z3o_ABCDEFGHO : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF SNF2-NUCLEOSOME COMPLEX IN ADP STATE
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 5z3o_A interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5z3o_B interface=31, akrhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 5z3o_C interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5z3o_D interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5z3o_E interface=1,2, RYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 5z3o_F interface= RHrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 5z3o_G interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 5z3o_H interface= trkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsiMnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 5z3o_O interface=153,308,397, lldqtkdtrithllrqtnafldyynvahrikedikkqpsilvggtlkdyqikglqwmvslfnnhlngilademglgktiqtislltylyemknirgpylvivplstlsnwssefakwaptlrtisfkgspnerkakqakiragefdvvlttfEyiikerallskvkwvhmiideghrmknaqsklsltlnthyhadyrliltgtplqnnlpelwallnfvlpkifnsvksfdewfntpfdkielseeetllvirrlhkvlrpfllrrlkkdvekelpdkvekvvkckmsalqqimyqqmlkyrrlgfNnqimqlkkicnhpfvfeevedqinptretnddiwrvagkfelldrilpklkatghrvliffqmtqimdimedflryinikylrldghtKsdersellrlfnapdseylcfilstragglglnlqtadtviifdtdwnphqdlqaqdrahrigqknevrilrlittnsveevileraykkldidgkviqagkfdnkstseeqeallrslldaeeerrkkrelkdseineilarndeemavltrmdedrskkeeksrllekkreesesaavyng
interface signature	R/R/R/R/RY/RH/R/M/ENK

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.573 IC/col=0.004 n_of_columns=143

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  22  15  25  24  24  24  24  24  27  24  19  20  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  30  27  15  27  24  24  24  24  24  25  24  39  34  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  22  51  22  24  24  24  24  24  22  24  19  22  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  25  15  22  24  24  24  24  24  22  24  19  20  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  24  24  24  24  24

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