6g0l_ABCDEFGHMW : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF TWO MOLECULES OF THE CHROMATIN REMODELLING ENZYME CHD1 BOUND TO A NUCLEOSOME
source	XENOPUS LAEVIS / SACCHAROMYCES CEREVISIAE S288C
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6g0l_A interface=3,26, phRyrpgtvalreirryqkstelliRklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlcgihakrvtimpkdiqlarrirger > 6g0l_B interface= kvLrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6g0l_C interface=17,27, trssraglqfpvgrvhRllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqgrvlpniqsvllpk > 6g0l_D interface=56, ktrkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6g0l_E interface=25,27,48, hryrpgtvalreirryqkstelliRkLpfqrlvreiaqdfktdlrfqSsavmalqeaseaylvglfedtnlcgihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6g0l_F interface=35, gkggakrhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6g0l_G interface=29, aktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6g0l_H interface= trkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamSimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6g0l_M interface=306,330,736,844, dfhgidivinhrlktsktvpdlnnckenyeflikwtdeshlhntwetyesigqvrglkrldnyckqfiiedqqvrldpyvtaedieimdmererrldefeefhvperiidsqrasledgtsqlqylvkwrrlnydeatwenatdivklapeqvkhfqnrenskilpqyssnytsqrprfeklsvqppfikggelrdfqltginwmaflwskgdngilademglgktvqtvafiswlifarrqngphiivvplstmpawldtfekwapdlncicymgnqksrdtireyefytnpktmkfnvllttyEyilkdraelgsikwqfmavdeahRlknaesslyeslnsfkvanrmlitgtplqnnikelaalvnflmpgrfnqdeeqeeyihdlhrriqpfilrrlkkdvekslpskterilrvelsdvqteyykniltknysimnelkkasnhpylfdnaeervlqkfmtrenvlrglimssgkmvlldqlltrlkkdghrvlifsqmvrmldilgdylsikginfqrldgtvpsaqrrisidhfnspdsndfvfllstragglginlmtadtvvifdsdwnpqadlqamarahrigqknhvmvyrlvskdtveeevlerarkkmileydmdsigesevralykailkfgnlkeildeliadgtlpvksfekygetydemmeaakdcvheeeknrkeileklekhatayraklksgeikaenqpkdnpltrlslkkreKkavlfnfkgvkslnaesllsrvedlkylknlinsnykddplkfslgnntpkpvqnwssnwtkeedeklligvfkygygswtqirddpflgitdkiflkkvpgaihlgRrvdyllsflrg > 6g0l_W interface=277,311,338,340,864, dfhgidivinhrlktsktvpdlnnckenyeflikwtdeshlhntwetyesigqvrglkrldnyckqfiiedqqvrldpyvtaedieimdmererrldefeefhvperiidsqrasledgtsqlqylvkwrrlnydeatwenatdivklapeqvkhfqnrenskilpqyssnytsqrprfeklsvqppfikggelrdfqltginwmaflwskgdngilademglgktvqtvafiswlifarrqngphiivvplstmpawldtfekwapdlncicymgNqksrdtireyefytnprakgkktmkfnvllttyEyilkdraelgsikwqfmavdeahrlkNaEsslyeslnsfkvanrmlitgtplqnnikelaalvnflmpgrfnqdeeqeeyihdlhrriqpfilrrlkkdvekslpskterilrvelsdvqteyykniltknysaltagakgghfsllnimnelkkasnhpylfdnaeervlqkfmtrenvlrglimssgkmvlldqlltrlkkdghrvlifsqmvrmldilgdylsikginfqrldgtvpsaqrrisidhfnspdsndfvfllstragglginlmtadtvvifdsdwnpqadlqamarahrigqknhvmvyrlvskdtveeevlerarkkmileydmdsigesevralykailkfgnlkeildeliadgtlpvksfekygetydemmeaakdcvheeeknrkeileklekhatayraklksgeikaenqpkdnpltrlslkkrekkavlfnfkgvkslnaesllsrvedlkylknlinsnykddplkfslgnntpkpvqnwssnwtkeedeklligvfkygygswtqirddpflgitdkiflkkvpgaihlgRrvdyllsflrggln
interface signature	RR/LR/RR/R/RLS/R/R/S/ERKR/NENER

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.104 IC/col=0.006 n_of_columns=176

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  20  18  22  24  27  24  24  24  24  24  24  22  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  16  24  24  24  24  24  24  24  27  23  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  22  42  20  24  24  24  24  24  45  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  18  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  20  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  19  18  25  24  25  24  24  24  24  24  24  22  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  16  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  22  18  38  24  24  24  24  24  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  34  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  33  24  24  24  38  18  22  24  22  24  24  24  24  24  24  30  27  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  16  24  24  24  24  24  24  24  25  31  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  20  24  22  18  19  24  24  24  24  24  16  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  42  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  21  24  24  24  19  42  27  24  22  24  24  24  24  24  24  22  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  48  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  34  24  30  18  19  24  24  24  24  24  19  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Tue Nov 29 18:33:08 2022