6iy2_ABCDEFGHO : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF SNF2-MMTV-A NUCLEOSOME COMPLEX AT SHL2 IN ADP STATE
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6iy2_A interface=5,48, kkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6iy2_B interface= akrhRkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvfLenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6iy2_C interface=1,32, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkkte > 6iy2_D interface=8, gkkrrktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6iy2_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6iy2_F interface= lrdNiqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirDavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6iy2_G interface=5,34, ktraKaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkk > 6iy2_H interface=5, rrktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6iy2_O interface=153,309,312, lldqtkdtrithllrqtnafldyynvahrikedikkqpsilvggtlkdyqikglqwmvslfnnhlngilademglgktiqtislltylyemknirgpylvivplstlsnwssefakwaptlrtisfkgspnerkakqakiragefdvvlttfEyiikerallskvkwvhmiideghrmknaqsklsltlnthyhadyrliltgtplqnnlpelwallnfvlpkifnsvksfdewfntpfdkielseeetllvirrlhkvlrpfllrrlkkdvekelpdkvekvvkckmsalqqimyqqmlkyrrlgfnNqiMqlkkicnhpfvfeevedqinptretnddiwrvagkfelldrilpklkatghrvliffqmtqimdimedflryinikylrldghtksdersellrlfnapdseylcfilstragglglnlqtadtviifdtdwnphqdlqaqdrahrigqknevrilrlittnsveevileraykkldidgkviqagkfdnkstseeqeallrslldaeeerrkkrelkdseineilarndeemavltrmdedrskkeeksrllekkreesesaavyng
interface signature	RR/RL/RR/R/RR/ND/KR/R/ENM

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.180 IC/col=0.008 n_of_columns=142

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  18  24  24  13  56  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  20  21  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  22  24  24  18  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  42  24  24  13  13  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  16  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  20  21  20  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  27  24  24  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  24  24  57  14  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  30  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  45  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  20  33  34  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  22  24  24  42  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  24  24  13  13  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  16  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  36  21  20  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  25  24  24  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Tue Nov 29 20:25:03 2022