6iy3_ABCDEFGHO : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF SNF2-MMTV-A NUCLEOSOME COMPLEX AT SHL-2 IN ADP STATE
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6iy3_A interface=5,48, kkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6iy3_B interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6iy3_C interface=1, Rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkkte > 6iy3_D interface=3,6, krRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6iy3_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6iy3_F interface= akrHrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvFlenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6iy3_G interface=5, ktraKaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllp > 6iy3_H interface=1,5, RrktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6iy3_O interface=153,309,312,397, lldqtkdtrithllrqtnafldyynvahrikedikkqpsilvggtlkdyqikglqwmvslfnnhlngilademglgktiqtislltylyemknirgpylvivplstlsnwssefakwaptlrtisfkgspnerkakqakiragefdvvlttfEyiikerallskvkwvhmiideghrmknaqsklsltlnthyhadyrliltgtplqnnlpelwallnfvlpkifnsvksfdewfntpfdkielseeetllvirrlhkvlrpfllrrlkkdvekelpdkvekvvkckmsalqqimyqqmlkyrrlgfnNqiMqlkkicnhpfvfeevedqinptretnddiwrvagkfelldrilpklkatghrvliffqmtqimdimedflryinikylrldghtKsdersellrlfnapdseylcfilstragglglnlqtadtviifdtdwnphqdlqaqdrahrigqknevrilrlittnsveevileraykkldidgkviqagkfdnkstseeqeallrslldaeeerrkkrelkdseineilarndeemavltrmdedrskkeeksrllekkreesesaavyng
interface signature	RR/R/R/RR/RR/HF/K/RR/ENMK

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.495 IC/col=0.010 n_of_columns=146

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  22  24  24  16  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  16  20  22  24  24  31  16  24  25  24  24  24  24  24  24  39  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  19  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  25  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  48  24  24  27  19  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  27  24  24  16  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  19  22  22  24  24  21  48  24  27  24  24  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  38  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  16  24  24  25  19  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  25  24  24  45  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  45  34  30  24  24  23  16  24  22  24  24  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  20  63  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  27  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  16  24  24  22  39  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  22  24  24  19  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  16  20  22  24  24  21  16  24  22  24  24  24  24  24  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  16  24  24  22  19  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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