6kw4_BNOPQRSTY : 3D-footprint complex

structure name	THE CLASSB RSC-NUCLEOSOME COMPLEX
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6kw4_B interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 6kw4_N interface=3,4,29,47, kpHRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6kw4_O interface=3,31, akAktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6kw4_P interface= srKesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsiMnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6kw4_Q interface=1,4,26,44, RyrPgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6kw4_R interface=21, akrhrkvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 6kw4_S interface=3,31,66, akAktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6kw4_T interface=2,8, sRkesyaIyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6kw4_Y interface=150,391,419, lldqtkdtritqllrqtnsflyyevahrikekidkqpsilvggtlkeyqlrglewmvslynnhlngilademglgktiqsislitylyevkkdpflvivplstitnwtlefekwapslntiiykgtpnqrhslqhqirvgnfdvllttyEyiikdksllskhdwahmiideghrmknaqsklsftishyyrtrnrliltgtplqnnlpelwallnfvlpkifnsaktfedwfntpfklelteeetlliirrlhkvlrpfllrrlkkevekdlpdkvekvikcklsglqqqlyqqmlkhnalglnnkimqlrkicnhpfvfdevegvvnpsrgnsdllfrvagkfelldrvlpkfkasghrvlmffqmtqvmdimedflrmkdlkymrldgStkteertemlnafnapdsdyfcfllstRagglglnlqtadtviifdtdwnphqdlqaqdrahrigqknevrilrlittdsveevileramqkldidgkviqagkfdnkstaeeqeaflrrlieseeldddelndtlarsadekilfdkidkermnqe
interface signature	R/HRLR/AR/KM/RPLR/R/ARR/RI/ESR

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=5.156 IC/col=0.033 n_of_columns=156

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10   9  22  24  21  20  24  24  24  24  24  27  15  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  15  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  18  13  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  12   0  15  24  24  24  24  24  24  48  14  14  13  14  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  14  24  24  24  24  24  24  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  67  30  24  21  22  24  24  24  24  24  22  15  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  42  17  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  42  13  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  12   0  15  24  24  24  24  24  24  16  14  56  10  14  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  54  24  24  24  24  24  24  21  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24
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T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13   9  22  24  23  20  24  24  24  24  24  25  15  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  49  24  24  24  24  22  23  24  24  24  24  24  24  24  24  18  13  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  12  96  15  24  24  24  24  24  24  16  14  13  10  16  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  14  24  24  24  24  24  24  31  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24

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updated Tue Nov 29 23:00:21 2022