6pa7_ABCDEFGHKP : 3D-footprint complex

structure name	THE CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN DNMT3A2-DNMT3B3 COMPLEX BOUND TO NUCLEOSOME.
source	XENOPUS LAEVIS / HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6pa7_A interface=4,5,47, kphRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6pa7_B interface= lrdNIqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirDavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6pa7_C interface=32, rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6pa7_D interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsiMnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6pa7_E interface=3,4,5, kpHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6pa7_F interface= kvLRDniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6pa7_G interface=33, trakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkkt > 6pa7_H interface= rktrkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsiMnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6pa7_K interface=99,259, hdqefdppkvyppvpaekrkpirvlslfdgiatgllvlkdlgiqvdryiasevcedsitvgmvrhqgkimyvgdvrsvtqkhiqewgpfdlviggspcNdlsivnparkglyegtgrlffefyrllhdarpkegddrpffwlfenvvamgvsdkrdisrflesnpvmidakevsaahraryfwgnlpgmnrplastvndklelqeclehgriakfskvrtdqhfpvfmnekedilwctemervfgfpvhytdvsnmsrLarqrllgrswsvpvirhlfaplkeyfacv > 6pa7_P interface= hdqefdppkvyppvpaekrkpirvlslfdgiatgllvlkdlgiqvdryiasevcedsitvgmvrhqgkimyvgdvrsvtqkhiqewgpfdlviggspcNdlsivnparkglyegtgrlffefyrllhdarpkegddrpffwlfenvvamgvsdkrdisrflesnpvmidakevsaahraryfwgnlpgmnrplastvndklelqeclehgriakfskvrtdqhfpvfmnekedilwctemervfgfpvhytdvsnmsrLarqrllgrswsvpvirhlfaplkeyfacv
interface signature	RYR/NID/R/M/HRY/LRD/R/M/NL/NL

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.047 IC/col=0.006 n_of_columns=165

specificity:

A |  21  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18   6  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  31  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  20  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42   6  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  21  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  38  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  78  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  23  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  19  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18   6  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  22  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Wed Nov 30 05:10:41 2022