6pww_AGHIJKLMN : 3D-footprint complex

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF MLL1 IN COMPLEX WITH RBBP5 AND WDR5 BOUND TO THE NUCLEOSOME
source	XENOPUS LAEVIS / HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6pww_A interface= dgtldcismaltctfnrwgtllavgcndgriviwdfltrgiakiisahihpvcslcwsrdghklvsastdnivsqwdvlsgdcdqrfrfpspilkvqyhprdqnkvlvcpmksapvmltlsdskhvvlpvdddsdlnvvasfdrrgeyiytgnakgkilvlktdsqdlvasfrvttgtsnttaiksiefarkgscflintadriirvydgreiltcgrdgepepmqklqdlvnrtpwkkccfsgdgeyivagsarqhalyiweksignlvkilhgtrgellldvawhpvrpiiasissgvvsiwaqnqvenwsafkeldenveyeeresefdi > 6pww_G interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6pww_H interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 6pww_I interface=31,66, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6pww_J interface=55, trkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6pww_K interface=4,6, kphRyRpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6pww_L interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 6pww_M interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6pww_N interface= trkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsiMnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	/R/R/RR/R/RR/R/R/M

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.121 IC/col=0.008 n_of_columns=145

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  54  20  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  19   9  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  22  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  48  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  39  14  38  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  38   9  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  30  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  22  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  14  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  19  69  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  14  19  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  20   9  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24

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updated Wed Nov 30 06:05:53 2022