6ryu_ABCDEFGHVW : 3D-footprint complex

structure name	NUCLEOSOME-CHD4 COMPLEX STRUCTURE (TWO CHD4 COPIES)
source	XENOPUS LAEVIS / HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6ryu_A interface=2,3,4, pHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6ryu_B interface= kRHRkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6ryu_C interface=27, trssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6ryu_D interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhpdtgissKamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6ryu_E interface=1,2, HRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6ryu_F interface=30, krhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6ryu_G interface=29,64, aktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6ryu_H interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6ryu_V interface=623, dhhmefcrvckdggellccdtcpssyhihclnpplpeipngewlcprctcpalkgkvqkiliwkwgperqffvkwqgmsywhcswvselqlelhcqvmfrnyqrkndmdeppseeksrkrknkdpkfaemeerfyrygikpewmmihrilnhsvdkkghvhylikwrdlpydqaswesedveiqdydlfkqsywnhrelmtvdptvkyerqpeyldatggtlhpyqmeglnwlrfswaqgtdtilademglgktvqtavflyslykeghskgpflvsaplstiinwerefemwapdmyvvtyvgdkdsraiirenefsfednairggkkasrmkkeasvkfhvlltsyelitidmailgsidwaclivdeahrlknnqskffrvlngyslqhkllltgtplqnnleelfhllnfltperfhnlegfleefadiakedqikklhdmlgphmlrrlkadvfknmpsktelivrvelspmqkkyykyiltrnfealnargggnqvsllnvvmdlkkccnhpylfpvaameapkmpngmydgsalirasgkllllqkmlknlkegghrvlifsqmtkmldlledflehegykyeridggitgnmrqeaidrfnapgaqqfcfllstRagglginlatadtviiydsdwnphndiqafsrahrigqnkkvmiyrfvtrasveeritqvakkkmmlthlvvrxxxxxxxxxxxx > 6ryu_W interface=623, dhhmefcrvckdggellccdtcpssyhihclnpplpeipngewlcprctcpalkgkvqkiliwkwgperqffvkwqgmsywhcswvselqlelhcqvmfrnyqrkndmdeppseeksrkrknkdpkfaemeerfyrygikpewmmihrilnhsvdkkghvhylikwrdlpydqaswesedveiqdydlfkqsywnhrelmtvdptvkyerqpeyldatggtlhpyqmeglnwlrfswaqgtdtilademglgktvqtavflyslykeghskgpflvsaplstiinwerefemwapdmyvvtyvgdkdsraiirenefsfednairggkkasrmkkeasvkfhvlltsyelitidmailgsidwaclivdeahrlknnqskffrvlngyslqhkllltgtplqnnleelfhllnfltperfhnlegfleefadiakedqikklhdmlgphmlrrlkadvfknmpsktelivrvelspmqkkyykyiltrnfealnargggnqvsllnvvmdlkkccnhpylfpvaameapkmpngmydgsalirasgkllllqkmlknlkegghrvlifsqmtkmldlledflehegykyeridggitgnmrqeaidrfnapgaqqfcfllstRagglginlatadtviiydsdwnphndiqafsrahrigqnkkvmiyrfvtrasveeritqvakkkmmlthlvvrxxxxxxxxxxxx
interface signature	HRY/RHR/R/K/HR/R/RR/R/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.588 IC/col=0.004 n_of_columns=149

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  22  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  19  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  22  30  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  27  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  38  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  42  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  49  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  31  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  25  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  25  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  17  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  23  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24

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updated Wed Nov 30 08:48:06 2022