structure name | OCT4-SOX2-BOUND NUCLEOSOME - SHL-6 (TRANSCRIPTION FACTOR SOX-2) |
source | HOMO SAPIENS |
experiment | NMR |
structural superfamily | HMG-box; |
sequence family | HMG high mobility group box; |
redundant complexes | 6yov |
links to other resources | NAKB PDIdb DNAproDB |
protein sequence | |
interface signature | RNFMRHNSY |
Estimated binding specificities ?
readout + contact |
A | 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 33 81 11 96 96 90 6 20 24 24 24 24 C | 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 21 4 67 0 0 2 6 22 24 24 24 24 G | 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 21 7 9 0 0 2 78 20 24 24 24 24 T | 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 21 4 9 0 0 2 6 34 24 24 24 24scan! |
Dendrogram of similar interfaces ?
matrix formatRTNGFTIARA--NASGST--YAPG L +-----------------------------1j46_A ! RCNAFTIARG--NC--SALTYAKT L --4 +-------------------------2gzk_A ! ! RTNTFTMARA--NGACST--YA-- L +---3 +4s2q_D ! +--------------1 RGNTFTMART--NGRTSA--WANT L +---------2 +7m5w_A ! RCNTFTMARAHGNAACST------ L +---------------4euw_A |
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updated Fri Sep 13 02:10:25 2024