structure nameCRYO-EM OF THE S. ISLANDICUS FILAMENTOUS VIRUS, SIFV
sourceSULFOLOBUS ISLANDICUS FILAMENTOUS VIRUS
experimentNMR
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureRNYRWYKLAE/RNYWYKLA/RNRWYKLA/RNRWYKLA/NRWYKLAE/RNYRWYKLA/NYRWYKLA/NYRWYKLA/RNYRWYKLA/NYRWYKLAE/NRWYKLA/NRWYKLA/RNRWYKLAE/NRWYKLA/RRNYWYKLA/NRWYKLA/RNYRWYKAE/QSIYFQ/QIYLYFFWQN/QSIYFFN/QSIYFFN/QSIYYFFWN/QSIYFF/QIYFFWN/SIYYFFQN/QSIYYFFQN/QIYFFWN/IYYFFQ/QSIYYFFW/QSIYYFFW/SIYYFFQN/QIYYFF/IYYFFQN/QIYYFFN

Estimated binding specificities ?

readout + contactlogo
# IC=45.113 IC/col=0.202 n_of_columns=223 specificity:   
A |  24  24  24  24  42  14  39  23  60  24  24  21  34  20  60   0  39  17  27  21  60  25  33  20  34  19  78   0  45  14  34  22  51  20  30  21  31  19  63   0  38  15  27  22  69  20  27  25  31  18  63   0  39  15  38  21  60  20  31  23  31  16  60   0  38  12  31  21  51  25  31  22  33  18  60   0  38  15  38  25  67  20  27  25  31  21  66   0  45  15  38  19  67  20  24  15  72   9  34   0  96  13  34  21  57  22  24  24  38  18  66   0  38  13  39  22  51  20  27  24  42  20  66   0  39  14  34  20  63  21  27  22  42  18  87   0  42  15  52  13  78  20  30  21  42  15  60   0  38  14  31  23  56  22  31  20  38  16  60   0  38  17  31  22  60  25  27  20  34  19  69   0  34  15  39  19  56  19  27  24  38  20  60   0  38  15  31  22  56  22  31  21  38  18  63   0  34  12  34  21  49  22  27  21  31  18  56   0  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  18  16  19  21  12  24  24  21  22  19  12   0  19  15  22  21  12  22  21  20  20  20   6   0  16  14  20  22  15  20  22  23  21  19  10   0  19  15  22  22   9  20  22  22  23  18  13   0  19  17  20  21  12  20  23  21  21  16  12   0  20  12  23  21  15  22  21  22  21  18  12   0  20  15  19  22  11  22  22  22  23  21  10   0  19  15  20  20  11  20  24  17   8   9  22   0   0  13  20  21  13  25  24  24  19  18  10   0  20  13  19  22  15  20  22  24  18  20  10   0  19  14  22  20  10  21  22  22  18  18   3   0  18  15  16  14   6  20  22  21  18  15  12   0  19  13  21  21  13  22  23  22  19  16  12   0  20  15  23  22  12  22  22  20  20  16   9   0  22  15  19  20  14  20  22  24  20  20  12   0  20  15  23  22  14  25  23  21  19  18  10   0  22  12  20  21  17  20  22  21  21  18  14   0  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  18  14  19  21  12  24  24  23  20  19  12   0  19  15  22  23  12  22  21  22  22  19   6   0  16  14  20  25  15  20  22  21  21  20  10   0  19  15  25  22   9  20  22  22  21  18  10   0  19  15  19  21  12  20  21  21  23  16  12   0  19  12  21  21  15  22  21  22  21  18  12   0  19  17  20  22   9  20  25  22  21  23  10   0  16  15  19  19   9  22  24  15   8   9  20   0   0  14  22  23  13  22  24  24  20  18  10   0  19  14  19  25  15  22  25  24  18  22  10   0  19  16  20  22  13  21  25  22  18  18   3   0  18  15  14  13   6  20  22  23  18  17  12   0  19  13  23  21  13  25  21  20  20  16  12   0  19  15  21  22  12  22  25  22  22  16   9   0  20  17  19  19  13  19  22  24  19  22  12   0  19  15  21  25  13  22  21  21  19  18  13   0  20  12  22  21  15  20  22  23  23  18  13   0  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  18  52  19  31  12  24  24  31  20  38  12  96  19  49  25  31  12  27  21  34  20  38   6  96  19  54  22  27  15  36  22  31  23  38  13  96  20  51  22  30   9  36  25  27  21  42  10  96  19  49  19  33  12  36  21  31  21  48  12  96  19  60  21  33  15  27  23  30  21  42  12  96  19  49  19  27   9  34  22  27  21  31  10  96  16  51  19  38   9  34  24  49   8  69  20  96   0  56  20  31  13  27  24  24  19  42  10  96  19  56  19  27  15  34  22  24  18  34  10  96  19  52  20  34  10  33  22  30  18  42   3  96  18  51  14  56   6  36  22  31  18  49  12  96  20  56  21  31  14  27  21  34  19  48  12  96  19  49  21  30  12  27  22  34  20  45   9  96  20  49  19  38  13  38  25  24  19  34  12  96  19  51  21  27  13  27  21  33  20  42  10  96  20  60  20  33  15  34  25  31  21  42  13  96  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24
scan!

home
updated Wed Nov 30 16:56:26 2022