6x0n_ABCDEFGHO : 3D-footprint complex

structure name	BRIDGING OF DOUBLE-STRAND DNA BREAK ACTIVATES PARP2/HPF1 TO MODIFY CHROMATIN
source	HOMO SAPIENS / XENOPUS LAEVIS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6x0n_A interface=3,4,5, kpHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6x0n_B interface=25, vlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 6x0n_C interface=2,5,33, tRakAktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkk > 6x0n_D interface=3,6, krRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6x0n_E interface=3,4,5,47, kpHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6x0n_F interface= vlRDNiqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenviRdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 6x0n_G interface=2, tRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkk > 6x0n_H interface=3,6, krRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6x0n_O interface=139, sdlrkevenhyklslpedfyhfwkfceeldpekpsdslsaslglqlvgpydilagkhktkglnfnlhwrfyydppefqtiiigdnktqyhmgyfrdspdefpvyvgineakknciivpngdnvfaavklfltkklkeiTdkkkinllknideklteaarelgysleqrtvkmkqrdkkvvtktfhgaglvvpvdkndvgyrelpetdadlkricktiveaasdeerlkafapiqemmtfvqfandecdygmglelgmdlfcygshyfhkvagqllplaynllkrnlfaeiieehlanrsqenidql
interface signature	HRY/R/RAR/RR/HRYR/RDNR/R/RR/T

Estimated binding specificities ?

readout + contact

# IC=8.069 IC/col=0.051 n_of_columns=157

specificity:

A |  24  24  24  24  27  14  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  16  18  24  24  84   0   9  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  66  14  24  19  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  13   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24   8   5  12  24  24  16  14  12  56  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  21  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  22  14  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  18  52  18  24  24   4   0   9  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  10  52  24  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  56   2  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  74   3  60  24  24  16  14  60  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  48  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  25  54  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  42  14  18  24  24   4   0  11  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  10  16  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  14  88  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24   7   3  12  24  24  45  52  12  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  22  14  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  18  14  42  24  24   4  96  67  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  10  14  24  38  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  13   2  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24   7  85  12  24  24  19  16  12  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  33  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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updated Wed Nov 30 18:27:38 2022