Estimated binding specificities ?

structure nameCRYO-EM STRUCTURE OF PIGGYBAC TRANSPOSASE SYNAPTIC COMPLEX WITH HAIRPIN DNA (SNHP)
(TRANSPOSASE)
sourceTRICHOPLUSIA NI
experimentNMR
structural superfamilyAN1-like Zinc finger;
multimeric complexes6x68_CD
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
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# IC=13.949 IC/col=0.199 n_of_columns=70 specificity:   
A |  57   0   0   0   0  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  24  24  24   0  76  24  24  24  24   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  96  24  24   6
C |  15   0   0  96   0  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  24  24  24   0   6  24  24  24  24   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0   0  24  24  76
G |  12   0  96   0  96   6  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  96  24  24  24   0   8  24  24  24  24   0  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  96   0  24  24   6
T |  12  96   0   0   0  66  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  24  24  24  96   6  24  24  24  24  96  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0   0  24  24   8
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updated Sat Sep 14 00:44:53 2024