6y5d_KMNOPQRST : 3D-footprint complex

structure name	STRUCTURE OF HUMAN CGAS (K394E) BOUND TO THE NUCLEOSOME
source	HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6y5d_K interface=140, gasklravleklklsrddistaagmvkgvvdhlllrlkcdsafrgvgllntgsyyehvkisapnefdvmfklevpriqleeysntrayyfvkfkrnpkenplsqflegeilsaskmlskfrkiikeeindikdtdvimkRkrggspavtllisekisvditlalesksswpastqeglriqnwlsakvrkqlrlkpfylvpkhakegngfqeetwrlsfshiekeilnnhgksetccenkeekccrkdclklmkylleqlkerfkdkkhldkfssyhvktaffhvctqnpqdsqwdrkdlglcfdncvtyflqclrteklenyfipefnlfssnlidkrskefltkqieyernnefpvfdef > 6y5d_M interface=3,4, phRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 6y5d_N interface= dnIQgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6y5d_O interface=30, kaksrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvymaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgkvtiaqggvlpniqavllp > 6y5d_P interface= esysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnSfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6y5d_Q interface=1, Ryrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaseaylvglfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirge > 6y5d_R interface= Dniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygf > 6y5d_S interface=1,32, RakaksrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvymaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgkvtiaqggvlpniq > 6y5d_T interface=2, sRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	R/RY/IQ/R/S/R/D/RR/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.159 IC/col=0.008 n_of_columns=153

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  19  56  19  24  24  24  31  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   8  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  19  13  19  24  24  24  23  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  72  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  39  13  39  24  24  24  21  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   8  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  19  14  19  24  24  24  21  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   8  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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