structure nameOCT4-SOX2-BOUND NUCLEOSOME - SHL+6
sourceHOMO SAPIENS / AEQUOREA VICTORIA, HOMO SAPIENS
experimentNMR
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureHRY/VLR/R/V/R/R/R/N/F/RNFMRNSSY

Estimated binding specificities ?

readout + contactlogo
# IC=6.515 IC/col=0.050 n_of_columns=131 specificity:   
A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7   6   0   0   0   4  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  18  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  74   6   0   0   0   4  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  31  18  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   8   6   0   0  96   4  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  21  18  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  78  96  96   0  84  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  23  42  24
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updated Wed Nov 30 20:14:43 2022