6z6p_ABCDEFGHM : 3D-footprint complex

structure name	HDAC-PC-NUC
source	XENOPUS LAEVIS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 6z6p_A interface=3,12,26,46, phRyrpgtvalReirryqkstelliRklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 6z6p_B interface= kvLrdniqgitKpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenVirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6z6p_C interface= trSsraglqfpVgrvhrllrkgnyaErvgagapvylaavleyltaEilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6z6p_D interface=3, ktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 6z6p_E interface=1,2,3,45, HRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 6z6p_F interface= NIQgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdAvtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 6z6p_G interface=2,64, aKtrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 6z6p_H interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 6z6p_M interface=139,141,142, sgdywlpttmslyqkeltdqivslhysdilryfetshykedvilesmktmclngslvathpyllidhympkslitrdvpahlaensgkfsvlrdlinlvqeyetetaivcrpgrtmdllealllgnkvhikrydghsiKsKNdfsctvhlfsseginftkypikskarfdmlicldttvdtsqkdiqyllqykrryapivrlvainsidhcrlffgkkfdknsreylenvtaamvilrdrlgtlppdlrpiysqklhylvewlenptvpwplpdiyplkqytsmdverslltevhfkknssnvnyhlssgiithkliqsmgevymdicvqkqelddysclddlqndhlkffsnedekiikeyetvlrtnnenlnrshelevennlkfsqietlekdietlkgslmaqgetlsklkdafvktdnvqdeiekeervsvsrdtekkymeqeikravdaireneeethklnekqngleselklkfekseistkelnekigflkkelklendlneelvgqlsktmdnlenltiprvrtq
interface signature	RRRR/LKRV/SVEE/R/HRYR/NIQA/KR/R/KKN

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=4.913 IC/col=0.035 n_of_columns=142

specificity:

A |  24  24  24  52  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  16   3  10  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  18  24  24  24  24  24  24  21  24  27  24  24  24  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   1   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  42  22  24  24  24  24  24  24  24  24  19  66  24  24  24  24  24  24  24  24  20  54  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  14  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  27  24  19  85  10  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  18  24  24  24  24  24  24  23  24  22  24  24  24  24  27  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  92   4  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  45  10  24  24  24  24  24  24  24  24  34  14  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  14  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  22  24  45   3  13  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  42  24  24  24  24  24  24  21  24  25  24  24  24  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   1  81  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  54  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  18  30  24  24  24  24  24  24  24  24  16  10  24  24  24  24  24  24  24  24  20  14  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  24  16   5  63  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  18  24  24  24  24  24  24  31  24  22  24  24  24  24  25  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   2   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  18  22  24  24  24  24  24  24  24  24  16  10  24  24  24  24  24  24  24  24  22  14  24  24  24  24  24

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