7k6q_ABCDEFGHK : 3D-footprint complex

structure name	ACTIVE STATE DOT1 BOUND TO THE H4K16AC NUCLEOSOME
source	XENOPUS LAEVIS / SACCHAROMYCES CEREVISIAE
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7k6q_A interface=3,4,5,47, kpHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfmtdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7k6q_B interface= gkGGArhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvLkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 7k6q_C interface=31, akaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 7k6q_D interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtcytsa > 7k6q_E interface=1,2,26,44, RYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfmtdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7k6q_F interface= RHrkvlrdniqgitkpairrlarrgGvkrisgliyeetrgvlkVflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7k6q_G interface= AKaktrssraglqfpvgrvhrllrkGnyaervgagapvylaavLeyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 7k6q_H interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtcytsa > 7k6q_K interface= sStfvdwngpclrlqyplfdieylrsheiysgtpiqsislrttaklqsilfsnymeeykvdfkrstaiynpmseigklieysclvflpspyaeqlketilpdlnasfdnsdtkgfvnainlynkmireiprqriidhletidkiprsfihdflhivytrsihpqanklkhykafsnyvygellpnflsdvyqqcqlkkgdtfmdlgsgvgncvvqaalecgcalsfgceimddasdltilqyeelkkrcklygmrlnnvefslkksfvdnnrvaelipqcdvilvnnflfdedlnkkvekilqtakvgckiislkslrsltyqinfynvenifnrlkvqrydlkedsvswthsggeyyistvmedvdeslfspaargrrpvky
interface signature	HRYR/GGAL/R/R/RYLR/RHGV/AKGL/R/S

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.093 IC/col=0.007 n_of_columns=146

specificity:

A |  24  24  24  24  22  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  15  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  56  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  16  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  23  16  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  49  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  39  16  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  45  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  30  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  17  15  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  48  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  19  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  15  51  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  16  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  31  16  24  24  24  24

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