7oh9_ABCDEFGHKL : 3D-footprint complex

structure name	NUCLEOSOME WITH TBP AND TFIIA BOUND AT SHL -6
source	XENOPUS LAEVIS / SACCHAROMYCES CEREVISIAE
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7oh9_A interface=3,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7oh9_B interface= vlRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvIrdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7oh9_C interface=1,32, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkk > 7oh9_D interface=1,2,5, RRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7oh9_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7oh9_F interface= rdnIqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdAvtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7oh9_G interface=30, kaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 7oh9_H interface=3, ktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7oh9_K interface=39,130, sgivptlqnivatvtlgcrldlktvalharnaeynpkrFaavimrirepkttalifasgkmvvtgakseddsklasrkyariiqkigfaakftdfkiqnivgscdvkfpirleglafshgtfssyepelFpgliyrmvkpkivllifvsgkivltgakqreeiyqafeaiypvlsefrkm > 7oh9_L interface= naeasrvyeiivesvvnevredfenagideqtlqdlknIwqkkltedylienlmlclydkvtrtkarwkcslkdgvvtinrndytfqkaqveaewv
interface signature	RR/RI/RR/RRR/RR/IA/R/R/FF/I

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.004 IC/col=0.007 n_of_columns=145

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  25  21  24  24  24  34  16  18  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  24  24  24  27  21  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  42  22  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  22  31  24  24  24  20  14  18  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  27  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  18  27  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  27  21  24  24  24  22  14  18  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  63  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  25  21  24  24  24  24  24  24  25  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  18  25  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  23  24  24  24  20  52  42  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  22  33  24  24  24  24  24  24  22  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24

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