7oha_ABCDEFGHKL : 3D-footprint complex

structure name	NUCLEOSOME WITH TBP AND TFIIA BOUND AT SHL +2
source	XENOPUS LAEVIS / SACCHAROMYCES CEREVISIAE
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7oha_A interface=3,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7oha_B interface=25, vlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7oha_C interface=1, Rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkk > 7oha_D interface=1,2,5, RRktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7oha_E interface=4,5,47, kphRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7oha_F interface= rdnIQgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdAvtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7oha_G interface=30, kaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 7oha_H interface= ktrkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamSimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7oha_K interface=9,39,54,130, sgivptlqNivatvtlgcrldlktvalharnaeynpkrFaavimrirepkttaLifasgkmvvtgakseddsklasrkyariiqkigfaakftdfkiqnivgscdvkfpirleglafshgtfssyepelFpgliyrmvkpkivllifvsgkivltgakqreeiyqafeaiypvlsefrkm > 7oha_L interface=77, naeasrvyeiivesvvnevredfenagideqtlqdlkniwqkkltetkddylisegeedgpdenlmlclydkvtrtKarwkcslkdgvvtinrndytfqkaqveaewv
interface signature	RR/R/R/RRR/RYR/IQA/R/S/NFLF/K

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.749 IC/col=0.014 n_of_columns=122

specificity:

A |  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  22  24  24  24  42  14  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  16  30  24  22  15  15  24  24  24  24  24  24  24  24  36  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  22  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  22  27  24  24  24  18  13  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  52  22  24  30  17  51  24  24  24  24  24  24  24  24  20  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  30  25  24  24  24  18  13  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  14  22  24  22  49  15  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  75  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  30  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  25  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  22  24  24  24  18  56  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  14  22  24  22  15  15  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  25  27  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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