7otq_ABCDEFGHK : 3D-footprint complex

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF ALC1/CHD1L BOUND TO A PARYLATED NUCLEOSOME
source	XENOPUS LAEVIS / HOMO SAPIENS
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7otq_A interface=3,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7otq_B interface= krHrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvFlenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7otq_C interface=2,27,60,62, tRssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkKtRiiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 7otq_D interface= kTrkesyaiyvykvlkqvhpdtgissKamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstiTsReiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7otq_E interface=2,45, hRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlaaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7otq_F interface= nIqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdAvtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7otq_G interface=22,64, aktrssraglqfpvgrvhrllRkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 7otq_H interface= trkesyaiyvykvlkqvhpdtGisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiQtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7otq_K interface= tgihlrsyqlegvnwlaqrfhCqngcilgdemglgktcqtialfiylagrlndegpflilcplSvlsnwkeemqrfapglscvtyagdkeeraclqqdlkqesrfhvllttyeiclkdasflksfpwsvlvvdeahrlknqssllhktlsefsvvfsllltgtpiqnslqelysllsfvepdlfskeevgdfiqryqdiekesesaselhkllqpfllrrvkaevatelpkktevviyhgmsalqkkyykailmkdldafenetakkvklqnilsqlrkcvdhpylfdgvepepfevgdhlteasgklhlldkllaflysgghrvllfsqmtqmldilqdymdyrgysyervdgsvrgeerhlaiknfgqqpifvfllstraggvgmnltaadtvifvdsdfnpqndlqaaarahrigqnksvkvirligrdtveeivyrkaasklqltnmiiegghft
interface signature	RR/HF/RRKR/TKTR/RR/IA/RR/GQ/CS

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.953 IC/col=0.013 n_of_columns=148

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   6   9  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  78   9  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  22  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   6  67  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  63  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  34  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   6  11  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  56  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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