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structure nameAPE1 BOUND TO A NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH AP-SITE AT SHL-6
experimentNMR
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureRR/NQ/R/R/RR/LV/RA/R/KYRNYMM

Estimated binding specificities ?

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# IC=3.094 IC/col=0.022 n_of_columns=143 specificity:   
A |  24  22  24  24  24  22   0  81  24  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  16  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  27  24  24  24  22   0   4  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  63  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  14  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  22  24  24  24  25  96   7  24  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  39  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  14  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  25  24  24  24  27   0   4  24  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  52  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
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