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structure namePOL II-DSIF-SPT6-PAF1C-TFIIS-NUCLEOSOME COMPLEX (STALLED AT +38)
experimentNMR
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureNKRQPTAR/D//G/RYP/RR/KS/RPR/R/R/RY

Estimated binding specificities ?

readout + contactlogo
# IC=5.302 IC/col=0.045 n_of_columns=117 specificity:   
A |  24   2  21  24  24  24  24  24  24  24  21  18   0   2  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  33  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  36  14  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  52  10  24  24  24  22  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24
C |  24  88  21  24  24  24  24  24  24  24  33  42   0   2  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  21  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  20  52  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  54  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  14  13  24  24  24  30  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24
G |  24   2  21  24  24  24  24  24  24  24  21  18   0   2  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  52  21  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  14  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  57  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  14  63  24  24  24  22  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24
T |  24   4  33  24  24  24  24  24  24  24  21  18  96  90  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  21  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  20  16  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  16  10  24  24  24  22  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24
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