7v96_ABCDEFGHKLMNOPQR : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	TELOMERIC DINUCLEOSOME
reference	Nature 609 1048 2022 Escherichia coli
experiment	X-ray (resolution=3.92, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7v96_A interface=5,6,7,31, vkkpHRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7v96_B interface= rkvlRDNiqgitkpairrlarrggvkrisgLiyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v96_C interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v96_D interface=7, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v96_E interface=1,5,8,48, KkphRyrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v96_F interface=2, kRhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v96_G interface=2,68,115, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHkakgk > 7v96_H interface=1, Kkrkrsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v96_K interface=4,5, kkpHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7v96_L interface=30, krhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v96_M interface=32,114,115, rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHKakgk > 7v96_N interface=7, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v96_O interface=4,5, kkpHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v96_P interface= rkvLRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v96_Q interface=2,68, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7v96_R interface= kKrkrsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreIqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	HRYL/RDNL/RR/R/KRPR/R/RRH/K/HR/R/RHK/R/HR/LR/RR/KI

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=6.509 IC/col=0.024 n_of_columns=275

specificity:

A |  67  74  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  34  24  24  24  17  92  60  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  67  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  45  12  24  24  24  52  51  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  56  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  13  19  24  24  24  24  24  24  24  24  38  70  14  24  24  24  24  42  22  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  16  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  10  10  27  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  39  24  24  24
C |   9   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  24  24  15   2  12  30  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24   9  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  16  60  24  24  24  14  15  24  24  24  24  24  24  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  56  39  24  24  24  24  24  24  24  24  19   8  52  24  24  24  24  18  27  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  48  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  63  10  25  24  24  24  31  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24
G |   9   8  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  15   1  12  22  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24   9  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  16  12  24  24  24  16  15  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  13  19  24  24  24  24  24  24  24  24  20  10  16  24  24  24  24  18  22  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  16  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  13  13  22  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24
T |  11   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  20  24  24  24  49   1  12  22  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  11  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  19  12  24  24  24  14  15  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  14  19  24  24  24  24  24  24  24  24  19   8  14  24  24  24  24  18  25  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  16  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  10  63  22  24  24  24  23  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24

scan!

home
updated Thu Dec 1 23:50:19 2022