7v9j_ABCDEFGHKLMNOPQRSTUVWXYZ : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	TELOMERIC TRINUCLEOSOME
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7v9j_A interface=4,5,6,14,30,48, kkpHRYrpgtvalReirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9j_B interface= rkvLRDniqgitkPairrlarrggvkrisGliyeetrgvlkvflenvIrdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9j_C interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9j_D interface=7,13, kkrkrsRkesysVyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9j_E interface=5,48, kkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9j_F interface=20,30, krhrkvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9j_G interface=26,33,115, arakaktrssraglqfpvgrvhrllRkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHkakgk > 7v9j_H interface= kkrkrsrkesysvyvykvlkqvhpdTgisskaMgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v9j_K interface=4,6,30,48, kkpHrYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9j_L interface=30, krhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9j_M interface=32,114, rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHkakgk > 7v9j_N interface=7, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9j_O interface=5,6,48, kkphRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9j_P interface=17,27, rkvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9j_Q interface=26,33, arakaktrssraglqfpvgrvhrllRkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7v9j_R interface=7, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v9j_S interface=6,48, kkphrYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9j_T interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9j_U interface=33, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9j_V interface=7, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9j_W interface=5,48, kkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9j_X interface=16, kvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9j_Y interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7v9j_Z interface=3,7, kkRkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	HRYRLR/LRDPGI/RR/RV/RR/RR/RRH/TM/HYLR/R/RH/R/RYR/RR/RR/R/YR/R/R/R/RR/R/RR/RR

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=4.099 IC/col=0.010 n_of_columns=399

specificity:

A |  15  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  18  24  24  24  24  24  24  27  24  18  19  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  21  22  38  31  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  30  24  24  24  24  24  24  24  24  17  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  19  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  15  24  20  24  24  24  24  24  24  24  52  38  19  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  27  24  24  24  15  22  24  24  24  12  15  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  18  22  24  24  24  22  22  24  24  24  16  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  67  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  49  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  42  18  24  24  24  24  24  24  22  24  42  39  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  39  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  31  22  19  21  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  34  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  49  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  38  30  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  38  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  51  24  34  24  24  24  24  24  24  24  14  19  39  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  34  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  25  24  24  24  51  25  24  24  24  60  49  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  45  42  22  24  24  24  27  30  24  24  24  45  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22   9  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  39  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  63  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  15  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  18  24  24  24  24  24  24  22  24  18  19  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  23  22  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  20  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  24  24  24  24  24  24  24  24  15  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  15  24  22  24  24  24  24  24  24  24  16  20  19  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  20  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  22  24  24  24  15  22  24  24  24  12  15  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  16  18  22  24  24  24  25  22  24  24  24  19  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  11  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  17  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  42  24  24  24  24  24  24  25  24  18  19  25  27  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  21  30  19  23  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  20  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  22  24  24  24  24  24  24  24  24  15  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  20  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  19  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  15  24  20  24  24  24  24  24  24  24  14  19  19  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  20  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  22  24  24  24  15  27  24  24  24  12  17  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  16  18  30  24  24  24  22  22  24  24  24  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20   9  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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