7v9k_ABCDEFGHKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefgh : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	TELOMERIC TETRANUCLEOSOME
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7v9k_A interface=4,5,30,48, kkpHRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9k_B interface=27, rkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9k_C interface=2,5, aRakAktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9k_D interface= kKrkRsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9k_E interface=5,8,48, kkphRyrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9k_F interface=30, krhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9k_G interface=2,115, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHkakgk > 7v9k_H interface=1,7, KkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v9k_K interface=4,5,48, kkpHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9k_L interface= krhRKvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflEnvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9k_M interface=25,32,67,117, rakaktrssraglqfpvgrvhrllRkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshhkaKgk > 7v9k_N interface=7, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9k_O interface=4,5,48, kkpHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9k_P interface= rkvLRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvIrdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9k_Q interface=8,33, arakaktRssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7v9k_R interface=7,60, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v9k_S interface=4,6, kkpHrYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9k_T interface=12, kvlrdniqgitKpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9k_U interface=2, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9k_V interface=7, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9k_W interface=5,8,48,82,83, kkphRyrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrVTimpkdiqlarrirgera > 7v9k_X interface=12,16,26, kvlrdniqgitKpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9k_Y interface= arakaktrssrAglqFpvgrvhrllRkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7v9k_Z interface=3, kkRkrsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v9k_a interface=4,6,14,30,34,46,48, kkpHrYrpgtvalReirryqkstellirkLpfqRlvreiaqdfktDlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9k_b interface=1,13, RkvlrdniqgitKpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9k_c interface=2, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9k_d interface=2, kKrkrsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9k_e interface=3,8, kkPhryrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9k_f interface=2,16,20,30, kRhrkvlrdniqgitKpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9k_g interface=2,112, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkktEshhkakgk > 7v9k_h interface=1,7, KkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	HRLR/R/RA/KR/RPR/R/RH/KR/HRR/RKE/RRRK/R/HRR/LRI/RR/RR/HY/K/R/R/RPRVT/KRR/AFR/R/HYRLRDR/RK/R/K/PP/RKRR/RE/KR

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=17.322 IC/col=0.032 n_of_columns=539

specificity:

A |  31  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  15  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  42  24  24  16   5  24  24  24  24  20   0  27  24  24  24  24  24  42  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  22  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  56  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24   8  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  96  69  19  24  24  24  38  24  24  24  24  24  24  30  19  24  24  20  63  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  96   0  18   9  15  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  20  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  63  60  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   0  18  85  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  38  24  24  24  24  14  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  27  16  24  24  22  24  45  16  17  24  24  24  24  24  24  24  22  24  60   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  22  24  24  24  24  24  21  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  52  17  24  24  24  24  24  20  10  24  24  24  24  24  24  24  14  34  24  24  24  24  24  24  30  22  24  24  24  31  31  24  24  20  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  33  24  24  24  24  24  27  18  24  24  24  24  49  24  24  21  14  24  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  24  24  24
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