7v9s_ABCDEFGHKLMNOPQRSTUVWXYZ : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	TELOMERIC TRINUCLEOSOME IN OPEN STATE
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7v9s_A interface=5,30,48, kkphRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9s_B interface=14,17,27, rkvlrdniqgitkPaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9s_C interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9s_D interface=7,13, kkrkrsRkesysVyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9s_E interface=1,5,48, KkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9s_F interface=16,17,20, krhrkvlrdniqgitKPaiRrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9s_G interface=2,26,33,115, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllRkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHkakgk > 7v9s_H interface=1,7,60, KkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v9s_K interface=5,30,48, kkphRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9s_L interface=17,30, krhrkvlrdniqgitkPairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9s_M interface=1,32,114, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHkakgk > 7v9s_N interface=7, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9s_O interface=5,30,48, kkphRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9s_P interface=17,27, rkvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9s_Q interface=2,26,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllRkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7v9s_R interface=7,60, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7v9s_S interface=4,5,6,14,30,48, kkpHRYrpgtvalReirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9s_T interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9s_U interface=33, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9s_V interface=7,13, kkrkrsRkesysVyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7v9s_W interface=4,5,6,7,8,48, kkpHRYRPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7v9s_X interface=12,16,26, kvlrdniqgitKpaiRrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7v9s_Y interface=2,33, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 7v9s_Z interface=7,60, kkrkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	RLR/PRR/RR/RV/KRR/KPR/RRRH/KRR/RLR/PR/RRH/R/RLR/RR/RRR/RR/HRYRLR/R/R/RV/HRYRPR/KRR/RR/RR

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=11.774 IC/col=0.031 n_of_columns=386

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  19  16  45  24  24  24  22  24  31  24  18  18  22  25  31  24  24  24  24  24  24  24  18  14  18  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  38  20  24  18  24  45  31  24  24  24  24  24  24  24  22  20  22  33  60  24  24  25  22  24  24  24  24  25  24  24  24  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  52  24  24  24  20  24  24  24  21  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  19  21  52  24  24  16  15  24  27  24  18  18  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  19  16  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  49   8  24  24  24  24  24  24  24  24  24  69  10  24  24  19  24  51  21  24  22  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  18  21  27  24  25  16  21  24  24  24  24  24  12  18  42  24  24  24   7  13  24  24  22   8  14  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  56  12  19  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  14  24  24  24  24  22  22  24  24  24  16  17  24  24  27  27  24  24  24  24  24  24  21  21  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  42   2  18  11  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  38  36  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  19  45  24  24  24  24  24  24  24  20  10  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  36  30  25  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  38  19  16  24  24  24  30  24  21  24  42  42  27  22  23  24  24  24  24  24  24  24  42  54  42  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  19  34  24  42  24  16  21  24  24  24  24  24  24  24  27  38  22  21  12  24  24  27  22  24  24  24  24  27  24  24  24  24  27  39  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  18  14  24  24  24  34  24  24  24  31  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  39  21  14  24  24  45  51  24  22  24  42  42  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  45  45  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  20  24  17  70  24  24  24  24  24  24  24  24  24   9  66  24  24  19  24  15  31  24  27  24  24  24  24  24  33  24  24  24  24  24  42  21  22  24  27  52  33  24  24  24  24  24  60  18  18  24  24  24  74  13  24  24  34  72  54  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  60  45  27  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  54  52  24  24  24  24  30  30  24  24  24  48  49  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  33  31  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  18  88  42  67  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  20  19  20  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  16  16  24  24  24  24  24  24  24  34  63  42  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  20  22  27  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  20  16  16  24  24  24  22  24  21  24  18  18  25  22  21  24  24  24  24  24  24  24  18  14  18  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  24  18  24  16  21  24  24  24  24  24  24  24  25  19  25  21  12  24  24  22  22  24  24  24  24  22  24  24  24  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  18  16  24  24  24  22  24  24  24  21  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  19  23  16  24  24  19  15  24  22  24  18  18  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  16  16  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  15   8  24  24  24  24  24  24  24  24  24   9  10  24  24  20  24  15  21  24  25  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  18  23  22  24  22  14  21  24  24  24  24  24  12  18  18  24  24  24   8  14  24  24  20   8  14  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  12  16  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  16  24  24  24  24  22  22  24  24  24  16  15  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  21  23  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  18   4  18   9  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  19  20  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  16  16  24  24  24  24  24  24  24  20  13  18  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  20  22  22  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  19  45  19  24  24  24  22  24  23  24  18  18  22  27  21  24  24  24  24  24  24  24  18  14  18  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  20  20  24  18  24  19  23  24  24  24  24  24  24  24  22  19  27  21  12  24  24  22  30  24  24  24  24  22  24  24  24  24  25  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  42  14  24  24  24  20  24  24  24  23  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  31  14  24  24  16  15  24  25  24  18  18  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  16  19  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  38  24  15  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24   9  10  24  24  38  24  15  23  24  22  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  18  31  25  24  22  14  21  24  24  24  24  24  12  42  18  24  24  24   7  56  24  24  20   8  14  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  12  16  25  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  14  24  24  24  24  22  22  24  24  24  16  15  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  21  21  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  24  18   2  18   9  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  34  20  20  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  45  19  24  24  24  24  24  24  24  22  10  18  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  20  22  22  24  24

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