7va4_ABCDEFGHKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefgh : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	TELOMERIC TETRANUCLEOSOME IN OPEN STATE
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7va4_A interface=1,4, RyrPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7va4_B interface= KvlRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7va4_C interface=65,68, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnKktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshhkakgk > 7va4_D interface=9,12, rsrkesysVyvYkvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7va4_E interface=1, Ryrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7va4_F interface=1,3, KrHrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7va4_G interface=33,65,68,115,120, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnKktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHkakgK > 7va4_H interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7va4_K interface=1,76, RyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihaKrvtimpkdiqlarrirger > 7va4_L interface=3, krHrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7va4_M interface=67,108,115,119, rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpKkteshhKakgK > 7va4_N interface=3,8, rsRkesySvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7va4_O interface=2,10,26,29,30,44,47, rYrpgtvalReirryqkstellirkLpfQRlvreiaqdfktdlRfqSsavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7va4_P interface=11,12,13,16, kvlrdniqgiTKPaiRrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7va4_Q interface=33, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7va4_R interface=56, rsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkRstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7va4_S interface= ryrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeAceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7va4_T interface=12,13,16,26,28, kvlrdniqgitKPaiRrlarrggvkRiSgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7va4_U interface=112,113, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkktEShhkakgk > 7va4_V interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7va4_W interface= ryRpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7va4_X interface=17, krhrkvlrdniqgitkPairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7va4_Y interface=8,68,115, arakaktRssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshHkakgk > 7va4_Z interface=3,10, rsRkesysvYvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 7va4_a interface=1,6,13,26, RyrpgTvalreiRryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 7va4_b interface=30, krhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7va4_c interface=1,32, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7va4_d interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7va4_e interface=1,26, RyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7va4_f interface=16, kvlrdniqgitkpaiRrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7va4_g interface=68, arakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktRiiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 7va4_h interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	RP/KR/KR/VY/R/KH/RKRHK/R/RK/H/RKKK/RS/YRLQRRS/TKPR/R/R/A/KPRRS/ES/R/R/P/RRH/RY/RTRL/R/RR/R/RL/R/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=13.595 IC/col=0.025 n_of_columns=539

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  21  24  24  24  24  19  24  24  22  24  24  20  16  14  24  24  38  18  24  24  12  16  24  24  24  24  21  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  24  31  20  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   7  13  22  24  30  24  24  25  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  12  10  19  15  42  24  24  24  22  21  27  24  24  24  24  24  38  20  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  12  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  24  24  22  18  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  27  24  24  24  24  22  24  24  24  19  24  11  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24   7   9   8  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  12  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14   4  24  24  24  27  12  24  22  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  25  24  24  24  24  24  24  24  24   0   0  31  22  24  24  24  24  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  17  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24   1  24  13  24  34  24  24  20  24  22  33  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21
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