7xx7_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYSTAL STRUCTURE OF NUCLEOSOME-H1X LINKER HISTONE ASSEMBLY (STICKY- 169A DNA FRAGMENT)
reference	Adhireksan et al. 'To ? ? ?
experiment	X-ray (resolution=2.70, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 7xx7_A interface=40,42,43, artkqtarkstggkaprkqlatkaarksapatggvkkphRyRPgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7xx7_B interface=16,17,44, grgkggkglgkggakRHrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7xx7_C interface=9,40, rgkqggkaRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshhkakgk > 7xx7_D interface=1,2,3, AVTkaqkkdgkkrkrsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 7xx7_E interface=39,40,41,83, artkqtarkstggkaprkqlatkaarksapatggvkkpHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 7xx7_F interface=44, grgkggkglgkggakrhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 7xx7_G interface=11,42, sgrgkqggkaRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkteshhkakgk > 7xx7_H interface=14,27,31, paksapapkkgskKavtkaqkkdgkkRkrsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak
interface signature	RRP/RHR/RR/AVT/HRYR/R/RR/KRR

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.276 IC/col=0.008 n_of_columns=165

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  23  24  25  24  24  27  20  22  24  24  24  23  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  74  16  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  38  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  21  24  24  24  24  24  24  27  24  18  16  24  24  24  24  24  25  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  33  34  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  21  24  22  24  24  22  20  22  24  24  24  31  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23   7  19  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  19  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  21  24  24  24  24  24  24  25  24  18  45  24  24  24  24  24  22  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  25  24  24  24  21  20  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  31  24  22  24  24  22  20  25  24  24  24  21  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21   7  45  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  21  24  24  24  24  24  24  22  24  42  16  24  24  24  24  24  22  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  21  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  27  24  24  25  36  27  24  24  24  21  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31   8  16  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  33  24  24  24  24  24  24  22  24  18  19  24  24  24  24  24  27  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  21  20  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

scan!

home
updated Sun Dec 15 19:26:18 2024