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structure nameYEAST RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH THE +1 NUCLEOSOME AND NTP (COMPLEX B)
experimentNMR
links to other resourcesNAKB PDBSum PDIdb DNAproDB
protein sequence
interface signatureRKH/AAD/RET/D/QNVFALFVTQNVFPLFVT/DRRMRPTVLTRLWVLVFM/F//N/R/RRR/R/R/M/RR/R/RK/MQ

Estimated binding specificities ?

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# IC=7.209 IC/col=0.034 n_of_columns=209 specificity:   
A |  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  21  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  24  24  24  34  18  24  24  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  17  24  24  24  24  24  24  24  24  25  60   9  13  96   2  70   0  92  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  20  42  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  15  24  24  24  24  24  24  24  24  22  12   9  10   0   2  10   0   1  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  33  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  20  18  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  15  24  24  24  24  24  24  24  24  22  12   9  10   0   2   8   0   2  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  21  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  49  24  24  24  24  24  24  24  24  27  12  69  63   0  90   8  96   1  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
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