8flj_AMN : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CAS1-CAS2/3 INTEGRASE AND IHF BOUND TO CRISPR LEADER, REPEAT AND FOREIGN DNA
reference	Santiago-Frangos et al. Nat.Struct.Mol.Biol. 30 1675 2023
experiment	X-ray (resolution=3.48, R-factor=?)
reference complex	8flj_A
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8flj_A interface=173,176,177,180,181,184,246,247, ilhskranlyylqhcrvlvnggrveyvtdegrhshywnipianttslllgtgtsitqaamrelaragvlvgfcggggtplfsanevdvevswltpqseyrpteylqrwvgfwfdeekrlvaarhfqrarlerirhswledrvlrdagfavdatalavavedsaraleqapnhEhlLTeeARlsKrlfklaaqatrygefvrakrgsggdpanrfldhgnylayglaatatwvlgiphglavlhgkTRrgglvfdvadlikdslilpqaflsamrgdeeqdfrqacldnlsraqaldfmidtlkdvaqrst > 8flj_M interface=55, mnillvsqcekralsetrrildqfaerrgertwqtpitqagldtlrrllkksarRntavachwirgrdhsellwivgdasrfnaqgavptnrtcrdilrkedendwhsaedirlltvmaalfhdigkasqafqaklrnrgkpmadayrhewvslrlfeafvgpgssdedwlrrladkretgdawlsqlarddrqsappgpfqksrlpplaqavgwlivshhrlpngdhrgsaslarlpapiqsqwcgardadakekaacwqfphglpfasahwrartalcaqsmlerpgllargpallhdsyvmhvsrlilmladhhysslpadsrlgdpnfplhantdrdsgklkqrldehllgvalhsrklagtlprlerqlprlarhkgftrrveqprfrwqdkaydcamacreqamehgffglnlastgcgktlangrilyaladpqrgarfsialglrsltlqtgqayrerlglgdddlailvggsaarelfekqqerlersgsesaqellaenshvhfagtledgplrewlgrnsagnrllqapilactidhlmpaseslrgghqiapllrlmtsdlvldevddfdiddlpalsrlvhwaglfgsrvllssatlppalvqglfeayrsgreifqrhrgapgrateircawfdefssqssahgavtsfseahatfvaqrlakleqlpprrqaqlctvhaagearpalcrmadlhrchhanieplielaqailaqgapeglhvhlcvyhsrhpllvrsaierqldellaalfarptlakaspvaevdydwaivepssmrsiiqlagrirrhnlyllsrnirslegqnpafqrpgfetpdfpldshdlallaridaspriveprsrlvdlehrrlralmladdppssllgvplwwqtpaslsgalqtsqpfragakercyallerlhfsrywsnqdnllrntwgtvnyreelvamagredldlrqcamrygevrlre > 8flj_N interface=55, mnillvsqcekralsetrrildqfaerrgertwqtpitqagldtlrrllkksarRntavachwirgrdhsellwivgdasrfnaqgavptnrtcrdilrkedendwhsaedirlltvmaalfhdigkasqafqaklrnrgkpmadayrhewvslrlfeafvgpgssdedwlrrladkretgdawlsqlarddrqsappgpfqksrlpplaqavgwlivshhrlpngdhrgsaslarlpapiqsqwcgardadakekaacwqfphglpfasahwrartalcaqsmlerpgllargpallhdsyvmhvsrlilmladhhysslpadsrlgdpnfplhantdrdsgklkqrldehllgvalhsrklagtlprlerqlprlarhkgftrrveqprfrwqdkaydcamacreqamehgffglnlastgcgktlangrilyaladpqrgarfsialglrsltlqtgqayrerlglgdddlailvggsaarelfekqqerlersgsesaqellaenshvhfagtledgplrewlgrnsagnrllqapilactidhlmpaseslrgghqiapllrlmtsdlvldevddfdiddlpalsrlvhwaglfgsrvllssatlppalvqglfeayrsgreifqrhrgapgrateircawfdefssqssahgavtsfseahatfvaqrlakleqlpprrqaqlvhaagearpalcrmadlhrchhanieplielaqailaqgapeglhvhlcvyhsrhpllvrsaierqldellaalfarptlakapvaevydwaivepssmrsiiqlagrirrhnlyllsrnirslegqnpafqrpgfetpdfpldshdlallaridaspriveprsrlvdlehrrlralmladdppssllgvplwwqtpaslsgalqtsqpfragakercysnqdnllrntwgtvnyreelvamagredldlrqcamrygevrlre
interface signature	ELTARKTR/R/R

Estimated binding specificities ?

readout + contact

# IC=3.200 IC/col=0.022 n_of_columns=148

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  14  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  42  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21   6   1  87  22  22  22  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  14  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  78   1   3  22  22  22  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  14  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  18  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31   6   2   3  27  22  25  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  54  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23   6  92   3  25  30  27  24  24  24  24  24  24

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