8qdx_ABCD : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	E. COLI DNA GYRASE BOUND TO A DNA CROSSOVER
experiment	NMR
structural superfamily	Type II DNA topoisomerase;
reference complex	7z9c_C 7z9c_D
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8qdx_A interface=20,117,170, areitpvnieeelkssyldYamsvivgralpdvrdglkpvhrrvlyamnvlgndwnkaykksarvvgdvigkyhphgdsavydtivrmaqpfslrymlvdgqgnfgsidgdsaaamRfteirlakiahelmadleketvdfvdnydgtekipdvmptkipnllvngssgIavgmatnipphnltevingclayiddedisieglmehipgpdfptaaiingrrgieeayrtgrgkvyiraraevevdaktgretiivheipyqvnkarliekiaelvkekrvegisalrdesdkdgmrivievkrdavgevvlnnlysqtqlqvsfginmvalhhgqpkimnlkdiiaafvrhrrevvtrrtifelrkardrahilealavalanidpiielirhaptpaeaktalvanpwqlgnvaamleragddaarpewlepefgvrdglyylteqqaqaildlrlqkltgleheklldeykelldqiaellrilgsadrlmevireelelvreqfgdkrrteitansad > 8qdx_B interface=397,399, sikvlkgldavrkrpgmyigdtddgtglhhmvfevvdnaidealaghckeiivtihadnsvsvqddgrgivsvvnalsqklelviqregkihrqiyehgvpqaplavtgetektgtmvrfwpsletftnvtefeyeilakrlrelsfnsgvsirlrdkrdgkedhfhyeggikafveylnknktpihpnifyfstekdgigvevalqwndgfqeniycftnnipqrdggthlagfraamtrtlnaymdkegyskkakvsatgddaregliavvsvkvpdpkfssqtkdklvssevksaveqqmnellaeyllenptdakivvgkiidaarareaarraremtrrkgaldlaglpgkladcqerdpalselylvegdsaggsakqgrnrknqailplKgKilnvekarfdkmlssqevatlitalgcgigrdeynpdklryhsiiimtdadvdgshirtllltffyrqpeiverghvyiaqpplykvkkgkqeqyikddeamdqyqisialdgatlhtnasapalagealeklvseynatqkminrmerrypkamlkeliyqptlteadlsdeqtvtrwvnalvselndkeqhgsqwkfdvhtnaeqnlfepivrvrthgvdtdypldhefitggeyrrictlgeklrglleedafiergerrqpvasfeqaldwlvkesrrglsiqrykglgemnpeqlwettmdpesrrmlrvtvkdaiaadqlfttlmgdaveprrafieenalkaanidi > 8qdx_C interface=80,117,170,561,611,762,765, areitpvnieeelkssyldyamsvivgralpdvrdglkpvhrrvlyamnvlgndwnkaykksarvvgdvigkyhphgdsAvydtivrmaqpfslrymlvdgqgnfgsidgdsaaamRfteirlakiahelmadleketvdfvdnydgtekipdvmptkipnllvngssgIavgmatnipphnltevingclayiddedisieglmehipgpdfptaaiingrrgieeayrtgrgkvyiraraevevdaktgretiivheipyqvnkarliekiaelvkekrvegisalrdesdkdgmrivievkrdavgevvlnnlysqtqlqvsfginmvalhhgqpkimnlkdiiaafvrhrrevvtrrtifelrkardrahilealavalanidpiielirhaptpaeaktalvanpwqlgnvaamleragddaarpewlepefgvrdglyylteqqaqaildlrlqkltgleheklldeykelldqiaellrilgsadrlmevireelelvreqfgdkrrteitansadinledlitqedvvvtlshqgyvkyqplseyeaqrrggKgksaarikeedfidrllvanthdhilcfssrgrvysmkvyqlpeatrgaRgrpivnllpleqderitailpvtefeegvkvfmatangtvkktvltefnrlrtagkvaiklvdgdeligvdltsgedevmlfsaegkvvrfkessvramgcnttgvrgirlgegdkvvslivprgdgailtatqngygkrtavaeyptksRatKgvisikvternglvvgavqvddcdqimmitdagtlvrtrvseisivgrntqgvilirtaedenvvglqrvae > 8qdx_D interface=397,399, sikvlkgldavrkrpgmyigdtddgtglhhmvfevvdnaidealaghckeiivtihadnsvsvqddgrgivsvvnalsqklelviqregkihrqiyehgvpqaplavtgetektgtmvrfwpsletftnvtefeyeilakrlrelsfnsgvsirlrdkrdgkedhfhyeggikafveylnknktpihpnifyfstekdgigvevalqwndgfqeniycftnnipqrdggthlagfraamtrtlnaymdkegyskkakvsatgddaregliavvsvkvpdpkfssqtkdklvssevksaveqqmnellaeyllenptdakivvgkiidaarareaarraremtrrkgaldlaglpgkladcqerdpalselylvegdsaggsakqgrnrknqailplKgKilnvekarfdkmlssqevatlitalgcgigrdeynpdklryhsiiimtdadvdgshirtllltffyrqmpeiverghvyiaqpplykvkkgkqeqyikddeamdqyqisialdgatlhtnasapalagealeklvseynatqkminrmerrypkamlkeliyqptlteadlsdeqtvtrwvnalvselndkeqhgsqwkfdvhtnaeqnlfepivrvrthgvdtdypldhefitggeyrrictlgeklrglleedafiergerrqpvasfeqaldwlvkesrrglsiqrykglgemnpeqlwettmdpesrrmlrvtvkdaiaadqlfttlmgdaveprrafieenalkaanidi
interface signature	YRI/KK/ARIKRRK/KK

Estimated binding specificities ?

contact

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specificity:

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