8siy_CDEFGHIJ : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	ORIGIN RECOGNITION COMPLEX ASSOCIATED (ORCA) PROTEIN BOUND TO H4K20ME3-NUCLEOSOME
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8siy_C interface=2,3,4,46, pHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirge > 8siy_D interface= dNIQgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdAvtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8siy_E interface=1, Rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpk > 8siy_F interface= Ktrkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 8siy_G interface=2,3,4,46, pHRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirge > 8siy_H interface= rHRVlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflEnvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8siy_I interface=1, Rakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllp > 8siy_J interface=2, tRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	HRYR/NIQA/R/K/HRYR/HRVE/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.414 IC/col=0.010 n_of_columns=147

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  27  25  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  16  25  24  24  25  10  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  23  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  25  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  49  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  16  27  24  24  22  10  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  31  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  22  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  17  56  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  16  22  24  24  27  63  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  21  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  22  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  42  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  48  22  24  24  22  13  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  21  24  24

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