9b3p_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	THE CRYO-EM STRUCTURE OF THE H2A.Z-H3.3 DOUBLE-VARIANT NUCLEOSOME
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 9b3p_A interface=3,4,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqsaaigalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 9b3p_B interface= niQGitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdaVtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 9b3p_C interface=30,65, avsrsqraglqfpvgrihrhlksrttshgRvgataavysaaileyltaevlelagnaskdlkvkRitprhlqlairgdeeldslikatiagggviphi > 9b3p_D interface= rkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsiMnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtAvrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 9b3p_E interface=3,46, phRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqsaaigalqeaseaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 9b3p_F interface=24,56, lrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehaKrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 9b3p_G interface=29,64, vsrsqraglqfpvgrihrhlksrttshgRvgataavysaaileyltaevlelagnaskdlkvkRitprhlqlairgdeeldslikatiagggviphihksli > 9b3p_H interface=7, rkesyaIyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	RYR/QGV/RR/MA/RR/RK/RR/I

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.640 IC/col=0.005 n_of_columns=128

specificity:

A |  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  18  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  21  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24
C |  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  42  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  21  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24
G |  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  18  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  33  24  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24
T |  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  38  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  18  24  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  21  24  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24

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