8jbx_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	HUMAN CANONICAL 601 DNA NUCLEOSOME
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8jbx_A interface=3,4,28,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirge > 8jbx_B interface= dnIQgitkpairrlarrggvkrisgliYeetrgvlkvflenvirdAvtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 8jbx_C interface= akAKtrssraglqfpvgrvhrllrkgnYservgagapvylaavleYltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 8jbx_D interface=3, rsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytss > 8jbx_E interface=3,4,29, kpHRyrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirge > 8jbx_F interface= dnIQgitkpairrlarrggvkrisgliyEetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 8jbx_G interface= akAKtrssraglqfpvgrvhrllrkgnyServgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 8jbx_H interface= srKEsysvyvykvlkqvhpdtgisskamGimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytss
interface signature	RYLR/IQYA/AKYY/R/HRL/IQE/AKS/KEG

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.646 IC/col=0.004 n_of_columns=145

specificity:

A |  24  24  24  30  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  21  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  22  60  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  17  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  21  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  27  12  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  15  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  31  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  25  12  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  49  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  23  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  22  12  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  15  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24

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