8jne_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	THE CRYO-EM STRUCTURE OF THE DECAMERIC RAD51 RING BOUND TO THE NUCLEOSOME WITHOUT THE LINKER DNA BINDING
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8jne_A interface=3,4,46, phRYrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirge > 8jne_B interface=21, niqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfg > 8jne_C interface=1,32, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 8jne_D interface= SrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimNsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts > 8jne_E interface=5,48, kkphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 8jne_F interface= dniqGitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavTytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8jne_G interface=28, ktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 8jne_H interface= rkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamGimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts
interface signature	RYR/R/RR/SN/RR/GT/R/G

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.830 IC/col=0.005 n_of_columns=153

specificity:

A |  24  24  24  24  25  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  49  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  18  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  38  24  24  24  22  51  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  33  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  17  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  42  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  19  24  24  24  34  15  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  27  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  36  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  18  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  20  15  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  18  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  20  24  24  24  20  15  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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