8ox0_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	STRUCTURE OF APO TELOMERIC NUCLEOSOME
reference	van Roon et al. 'Sci 9 eadi4148 2023
experiment	X-ray (resolution=2.52, R-factor=?)
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8ox0_A interface=3,4,47, kpHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8ox0_B interface=3, akRhrkvlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8ox0_C interface=2,33, aRakaksrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaeRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 8ox0_D interface=2, kRkrsrkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytssk > 8ox0_E interface=4,5,29,47, kphRYrpgtvalreirryqkstellirkLpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirger > 8ox0_F interface= rhrKVlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflEnvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8ox0_G interface=2, aRakaksrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 8ox0_H interface=2,6, kRkrsRkesysvyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytssk
interface signature	HRR/R/RR/R/RYLR/KVRE/R/RR

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.632 IC/col=0.011 n_of_columns=145

specificity:

A |  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  13  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  15  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  57  22  24  24  21  14  51  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  10  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  17  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  13  25  24  24  21  13  15  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  63  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  49  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  48  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  13  27  24  24  23  13  15  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  45  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  10  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  15  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  34  13  22  24  24  31  56  15  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24

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