8sn0_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE IN COMPLEX WITH RNF168 AND UBCH5C~UB (UBCH5C CHEMICALLY CONJUGATED TO HISTONE H2A. NO DENSITY FOR UB.) (CLASS 5)
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8sn0_A interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8sn0_B interface= kvlRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvIrdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8sn0_C interface= sakActrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleYltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 8sn0_D interface=1,4, KrsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts > 8sn0_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8sn0_F interface= vlrDniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenviRdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8sn0_G interface=32, sakactrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 8sn0_H interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts
interface signature	RR/RI/AY/KR/RR/DR/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.693 IC/col=0.005 n_of_columns=146

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  19  24  24  24  24  24  24  24  24  30  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  36  19  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  39  39  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  63  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  20  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  19  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  38  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  19  24  24  24  24  24  24  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  20  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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