8u13_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE UBIQUITYLATED AT HISTONE H2A LYSINE 15 IN COMPLEX WITH RNF168-UBCH5C (CLASS 1)
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8u13_A interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8u13_B interface= kvlRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvIrdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8u13_C interface= sasAktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleYltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 8u13_D interface=1,5, RkrsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts > 8u13_E interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8u13_F interface=25, vlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8u13_G interface=32, sasaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkt > 8u13_H interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts
interface signature	RR/RI/AY/RR/R/R/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.495 IC/col=0.010 n_of_columns=145

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  56  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  42  13  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  12  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  42  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  14  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  60  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  18  63  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  18  13  24  24  24  24  24  24  24  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  12  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  18  56  24  24  24  24  24  24  24  34  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  12  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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