8u14_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE UBIQUITYLATED AT HISTONE H2A LYSINE 15 IN COMPLEX WITH RNF168-UBCH5C (CLASS 2)
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8u14_A interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8u14_B interface=26, kvlrdniqgitkpairrlarrggvkRisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8u14_C interface= sasaktrssraglqfpvgrvhrllrKgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 8u14_D interface=1, Rkrsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts > 8u14_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8u14_F interface= vlrDniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenviRdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8u14_G interface=32, sasaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkt > 8u14_H interface=3, rsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts
interface signature	RR/R/K/R/RR/DR/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.566 IC/col=0.011 n_of_columns=146

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  60  10  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  15  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  45  27  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  12  10  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  45  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  17  13  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  16  25  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  12  10  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  49  10  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  12  66  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  15  63  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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