8ybj_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE COMPOSED OF THE WIDOM 601 DNA SEQUENCE
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8ybj_A interface=1,44, RyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8ybj_B interface= VlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvfleNvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8ybj_C interface=1,32, RakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 8ybj_D interface=1, Rkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa > 8ybj_E interface=1,2,45, HRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8ybj_F interface= LRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvIrdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8ybj_G interface=2, aRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpk > 8ybj_H interface=1, Rkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsa
interface signature	RR/VN/RR/R/HRR/LRI/R/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.349 IC/col=0.009 n_of_columns=145

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  20  63  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  33  60  18  24  24  24  25  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  19  10  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  49  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  21  24  24  24  21  12  18  24  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  38  13  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  17  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  39  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  31  24  24  24  21  12  18  24  24  24  27  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  19  10  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  19  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  23  24  24  24  21  12  42  24  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24

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