8u5h_IJKMOQRS : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN DNMT3A UDR BOUND TO H2AK119UB1-MODIFIED NUCLEOSOME
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8u5h_I interface=2,3,46, pHRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqrsavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8u5h_J interface= rKVlrdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvfleNvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8u5h_K interface=2, tRakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkc > 8u5h_M interface=3, ktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak > 8u5h_O interface=4, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlrfqrsavmalqeaseaylvalfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8u5h_Q interface= kvlRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvirdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8u5h_R interface= akaKtrssraglqfpvgrvhrllrkgnyaervgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlavrndeelnkllgrvtiaqggvlpniqsvllpkc > 8u5h_S interface=4, rktRkesyaiyvykvlkqvhpdtgisskamsimnsfvndvferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkytsak
interface signature	HRR/KVN/R/R/R/R/K/R

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=1.187 IC/col=0.008 n_of_columns=157

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  12  24  24  30  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  33  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  52  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  51  42  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  63  12  24  24  22  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  14  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  13  12  24  24  22  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  16  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  15  18  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  10  60  24  24  22  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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