8upf_ABCDEFGH : 3D-footprint complex

Interface of input file ?

structure name	CRYO-EM STRUCTURE OF THE HUMAN NUCLEOSOME CORE PARTICLE IN COMPLEX WITH RNF168-UBCH5C
experiment	NMR
links to other resources	NAKB PDIdb DNAproDB
protein sequence	> 8upf_A interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8upf_B interface= kvlRdniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenvIrdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8upf_C interface= sakAktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyservgagapvylaavleYltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkk > 8upf_D interface=1,5, RkrsRkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgimnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts > 8upf_E interface=4,47, kphRyrpgtvalreirryqkstellirklpfqrlvreiaqdfktdlRfqssavmalqeaceaylvglfedtnlcaihakrvtimpkdiqlarrirgera > 8upf_F interface= vlrDniqgitkpairrlarrggvkrisgliyeetrgvlkvflenviRdavtytehakrktvtamdvvyalkrqgrtlygfgg > 8upf_G interface=32, sakaktrssraglqfpvgrvhrllrkgnyseRvgagapvylaavleyltaeilelagnaardnkktriiprhlqlairndeelnkllgrvtiaqggvlpniqavllpkkt > 8upf_H interface= rsrkesysiyvykvlkqvhpdtgisskamgiMnsfvndiferiageasrlahynkrstitsreiqtavrlllpgelakhavsegtkavtkyts
interface signature	RR/RI/AY/RR/RR/DR/R/M

Estimated binding specificities ?

contact

# IC=0.805 IC/col=0.006 n_of_columns=146

specificity:

A |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  67  14  22  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  20  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
C |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24   9  16  27  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  42  21  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
G |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  11  14  22  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  31  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  30  19  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24
T |  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  25  24  24  24  24  24  24   9  52  25  24  24  24  27  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  18  23  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  38  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  22  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24  24

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