Interface of input file ?
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| structure name | CRYO-EM STRUCTURE OF FOXA1 IN COMPLEX WITH ALBN1 NUCLEOSOME (CLASS 2) |
| experiment | NMR |
| structural superfamily | "Winged helix" DNA-binding domain; |
| sequence family | Fork head domain; |
| multimeric complexes | 7vox_CH |
| redundant complexes |  7vox_A
|
| links to other resources | NAKB  PDIdb DNAproDB |
| protein sequence | |
| interface signature | LNRHSR |
Estimated binding specificities ?
| contact |  |
A | 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 19 20 14 10 13 49 22 49 10 57 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 C | 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 19 22 56 8 10 15 27 17 8 13 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 G | 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 20 34 13 8 63 17 25 15 70 13 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 T | 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 38 20 13 70 10 15 22 15 8 13 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24 24scan! |
Dendrogram of similar interfaces ?
matrix format----------------NAST--RGHT--STFT----------RTRA L +-----------1vtn_C +--------5 ------------------------------------KGKG------ L +------7 +-----------5xfq_A ! ! --------------KT--RG----RGYA----KA------------ L ! +--------------------5jvt_A ! ----------------NAST--RGHT--STLT-------------- L ! +-----7cby_C ! +-2 ------ST--------NAST--RTHT--STLT-------------- L ! +--------------3 +-----4lg0_A ! ! ! RT--LA--NTHGTTETYTRG-------------------------- L -11 +-8 +-------1f4k_B ! ! ! ----------RGSTRTSTHG--------------------RA---- L ! ! ! +3zpl_B ! ! +---------------------1 ------------------RC----YG--------KT---------- ! +--9 +2acj_B ! ! ! ------ST--------NAST--RTHT--ST---------------- L ! ! ! +---------3l2c_A ! ! ! +----------4 ----------------RGNT--RGSTAT--RA-------------- L +-10 +---6 +---------2o6g_G ! ! --TT--------KATTQTTG----LTRT----KA------------ L ! +--------------------2p7c_B ! --------------KT--RGAT--RGNT------------------ L +---------------------------8smh_F |
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updated Tue Jun 30 18:42:37 2026